Практикум 5.

Каталитическая активность.

Альтернативное название моего белка - DPN-kinase. EC: 2.7.1.23. Катализирует реакцию ATP + NAD(+) <=> ADP + H(+) + NADP(+). То есть катализирующие перенос фосфатной группы от молекулы аденозинтрифосфата (АТФ).

1.Активный центр.

Активный центр состоит из 1-ого аминокислотного остатка: ASP-45. Соответственно взаимодействий между остатками каталитического центра нет.

1.1.Активный центр белка.
1.2.Аминокислотное окружение активного центра белка (до 5 Å) и взаимодействия между остатками активного центра и окружением.

2.Ингибитор.

Ингибитором DPN-kinase является лиганд K2K (NKI1). Расстояние между активным центром и ингибитором - 3.6 А. Между ингибитором и активным центром не было найдено полярных взаимодействий. Можно предположить, что лиганд является ингибитором, делая недоступным активный центр для другого субстрата.

1.3. Ингибитор и расстояние между ингибитором и активным центром.