На главную страницу третьего семестра

Бутстреп - анализ, выполненный с помощью программы Bootstrap.

Цель задания — провести бутстреп-анализ выравнивания мутированных последовательностей, соответствующих листьям дерева.

Ветви, содержащиеся в консенсусном дереве и их бутстреп-значения:


ECDFBA
....**                     86.00 
.**...                     84.00 
...***                     84.00

Ветви, не включенные в консенсусное дерево и их бутстреп-значения:

ECDFBA
.***..                     11.00
...*.*                     10.00
..**..                      8.00
..****                      7.00
.**.**                      5.00
...**.                      4.00
.*.*..                      1.00


В результате было полученно консенсусное дерево:


  +---------------------------mut e
  |
  |                    +------mut a
  |             +-86.0-|
  |      +-84.0-|      +------mut b
  |      |      |
  +------|      +-------------mut f
         |
         |             +------mut c
         +--------84.0-|
                       +------mut d





Здесь можно видеть исходное дерево и его топологию.
После сравнения деревьев и их топологий, стало понятно, что реконстуированное дерево cовпадает с исходным.
Соответствующие бутстреп-значения внутренних ветвей можно видеть на кладограмме реконструированного дерева.

На предыдущую страницу
© Андреева Мария аka mashik, 2005