Описание свойств железосодержащего белка сукцинат дегидрогеназы в производных базах данных
Базы данных InterPro, PFAM, Prosite etc
- PROSITE - база данных мотивов аминокислотных последовательностей с поиском по паттернам, правилам и профилям
- PFAM - база данных, содержащая множество доменов и производящая поиск по профилям-HMM.
- InterPro - интегрированная база данных, содержит белковые семейства, функциональные сайты, домены etc, и позволяет много узнать о неизвестной последовательности.
Задания:
C помощью PROSITE найти известные мотивы в DHSB_ECOLI
C помощью PFAM определить доменную структуру DHSB_ECOLI
C помощью InterPro ищучить некоторые записи этой БД из DHSB_ECOLI