Солевые и водные мостики в белке β-порфириназа из бактерии Zobellia galactanivorans

На рис.1 приведены все аминокислоты, образующие солевые мостики в белке β-порфириназы. Получены они с помощью легкой и интуитивно понятной команды JMol

select within(GROUP,within(3.5, arg*.nh? or arg*.ne or his*.ne2 or his*.nd1 or lys*.nz) and (asp*.od? or glu*.oe?)) or within(GROUP,within(3.5, asp*.od? or glu*.oe?) and (arg*.nh? or arg*.ne or his*.ne2 or his*.nd1 or lys*.nz))"

Рис. 1. Солевые мостики в белке β-порфириназа из бактерии Zobellia galactanivorans.

Более детально один из них разобран на рис.2.

Рис. 2. Солевой мостик в белке β-порфириназа из бактерии Zobellia galactanivorans.

Водяной мостик изображен на рис.3

Рис. 3. Водяной мостик в белке β-порфириназа из бактерии Zobellia galactanivorans.