Бактерия Streptobacillus moniliformis
Таксономия [1]
| Империя | -Cellular organisms | |
| Надцарство | -Bacteria (eubacteria) | [superkingdom] |
| Класс | - Fusobacteriia | [class] |
| Отряд | - Fusobacteriales | [order] |
| Семейство | - Leptotrichiaceae | [family] |
| Род | - Streptobacillus | [genus] |
| Вид | - Streptobacillus moniliformis | [species] |
Протеом и геном бактерии [2]
- Количество белков – 1423
- Тип хромосомы – кольцевая
- Длина хромосомы – 1662578 пар нуклеотидов
- Средняя длина гена – 1017,107 пар нуклеотидов
- GC-состав – 26,3% (количество пар G≡C – 26,3% и, соответственно, A=T – 73,7%)
- Кодирующая поверхность ДНК (CDS) – 88% (процент ДНК, занятой генами)
- Количество генов – 1434
Актуальность секвенирования генома [3]
Этот организм был выбран для секвенирования генома на основе его филогенетического положения (схема 1), и является частью проекта «Genomic Encyclopedia of Bacteria and Archaea»:
Схема 1. Филогенетическое положение S.Moniliformis.
Описание бактерии [3]
Рис.1 Электронная микрофотография S. moniliformis 9901T [3]Streptobacillus moniliformis (рис.1) является единственным видом рода Streptobacillus и представляет филогенетический интерес из-за её изолированного расположения в редких популяциях. S.Moniliformis является грамотрицательной (рис.2), неподвижной, плеоморфной, привередливой, медленно растущей анаэробной бактерией. Растёт путём удлинения (от 0.3-0.7 мкм до 1-5 мкм в длину) и, как правило, образует цепочки или нити. Основная среда обитания S.Moniliformis – это мелкие грызуны, такие как крысы (подавляющее большинство) и реже песчанки, белки и мыши (является частью микрофлоры носоглотки [4]). Плотоядные животные, в чей рацион входят грызуны (собаки, кошки, хорьки), также могут стать хозяевами и, таким образом, передать возбудителя человеку (проявляется в виде содоку - «rat-bite fever» [4]). Тем не менее, бактерии не передаются непосредственно от человека к человеку и, следовательно, представляют собой типичных зооноз.
Рабочая статья [3]
«Complete genome sequence of Streptobacillus moniliformis type strain (9901T)»
Опубликована в сети 30 декабря 2009 года.
Авторы
Nolan M, Gronow S, Lapidus A, Ivanova N, Copeland A, Lucas S, Del Rio TG, Chen F, Tice H, Pitluck S, Cheng JF, Sims D, Meincke L, Bruce D, Goodwin L, Brettin T, Han C, Detter JC, Ovchinikova G, Pati A, Mavromatis K, Mikhailova N, Chen A, Palaniappan K, Land M, Hauser L, Chang YJ, Jeffries CD, Rohde M, Spröer C, Göker M, Bristow J, Eisen JA, Markowitz V, Hugenholtz P, Kyrpides NC, Klenk HP, Chain P.
Идентификатор PubMed (PMID): 21304670
Абстракт
Streptobacillus moniliformis Levaditi et al. 1925 является типичным и единственным видом рода Streptobacillus, и представляет филогенетический интерес из-за её изолированной локализации в малонаселённых местах и ни таксономически, ни геномно не соответсвует семейтву Leptotrichiaceae в рамках типа Fusobacteria. Семейство Leptotrichiaceae не было хорошо охарактеризовано геномно или таксономически. S. moniliformis является грамотрицательной, неподвижной, плеоформной бактерией и является этиологическим агентом болезни от укуса крыс (содоку) и хейверхиллской лихорадки (стрептобациллёза). Штамм 9901(T), типичный штамм вида, был изолирован от пациента с лихорадкой от крысиного укуса. Здесь описываются особенности этого организма вместе с полной последовательность генома и замечаниями. Это только второй полностью секвенированный геном отряда Fusobacteriales и не более чем третий из типа Fusobacteria. Хромосома длиной 1,662,578 пар нуклеотидов и плазмида длиной 10,702 пар нуклеотидов с 1511 белок-кодирующими и 55 РНК-кодирующими генами являются частью проекта «Genomic Encyclopedia of Bacteria and Archaea».
Поиск статей проводился с помощью запроса (Streptobacillus moniliformis) and (2000:2012[DP])
Количество полученных результатов – 54
{без фильтра, ограничивающего время выхода статьи, – 179}
| Рис (2): Аспект грамотрицательности | Внешний вид колоний на кровяном агаре |