Учебная страничка Васюткиной Ольги

Поиск последовательности Шайн-Дальгарно в геноме археи Methanococcus voltae

Вначале из генома археи Methanococcus voltae, штамм А3 были взяты гены с Uniprot Protein Evidence 1,2,3 (довольно-таки надежные), и для каждого из этих генов были вырезаны участки -35:0.
Файл с полученными последовательностями: загрузить

Для создания профиля PWM и нахождения последовательности Шайн-Дальгарно был использован сервис MEME. Далее с помощью программы MAST по всем последовательностям был запущен поиск по построенному профилю. На рис. 1 представлен лого найденной последовательности Шайн-Дальгарно.
Файл MEME: загрузить.
Файл MAST: загрузить.

Рис. 1

Рис. 1. Лого последовательности Шайн-Дальгарно в геноме археи Methanococcus voltae, штамм А3. Получено с помощью MEME


Valid HTML 4.01 Transitional