от обезьяны к биоинформатику!
Скобочная структура дерева -(A:100,(B:80,(((C:20,D:20):10,E:30):30,F:40):20):20) в данной записи количество мутаций представленно а 100 нуклеотидов. Чтобы перевести это значения в общие число мутаций их нужно умножить на 18.08.((1808/100)*n). Ниже можно увидеть построеное дерево.
Мутантные последовательности получены с помощью msbar из пакета Emboss. Скрипт представлен ниже.
msbar nuc_ecoli.entret a -point 4 -count 1808 -auto msbar nuc_ecoli.entret bfecd -point 4 -count 362 -auto msbar bfecd b -point 4 -count 1446 -auto msbar bfecd fecd -point 4 -count 362 -auto msbar fecd f -point 4 -count 723 -auto msbar fecd ecd -point 4 -count 542 -auto msbar ecd e -point 4 -count 542 -auto msbar ecd cd -point 4 -count 181 -auto msbar cd c -point 4 -count 362 -auto msbar cd d -point 4 -count 362 -auto