Седьмой семестр

Ссылки на все выполненные практикумы находятся в меню слева.

Первый практикум был посвящен визуализации электронной плотности в PyMol.
В следующем практикуме по PDB-файлу была восстановлена структура кристалла белка и проанализированы взаимодействия между белками из разных асимметрических единиц.
Третий практикум заключался в разложении смоделированной функции электронной плотности в ряд Фурье и определении разрешения набора гармоник ряда Фурье (в том числе для случаев, когда набор гармоник неполный).
Помимо методов РСА для получения трехмерной структуры белка используется и метод ЯМР. В четвертом практикуме было изучено, как соотносятся структуры белков, построенных этими двумя методами.
Также в этом семестре мы изучали алгоритмы, используемые в структурной биологии, на примере задач предсказания элементов вторичной структуры (практикум 5), поиска гидрофобных кластеров (практикум 6), построения поверхности белка (практикум 7) и совмещения структур гомологичных белков (практикум 8).

Отчет по валидации структуры Cu,Zn-супероксиддисмутазы 1PU0 доступен по ссылке: pdf.

© Наталия Кашко, 2017