|
Седьмой семестр
|
|
Ссылки на все выполненные практикумы находятся в меню слева.
Первый практикум был посвящен визуализации электронной плотности в PyMol.
В следующем практикуме по PDB-файлу была восстановлена структура кристалла
белка и проанализированы взаимодействия между белками из разных асимметрических единиц.
Третий практикум заключался в разложении смоделированной функции электронной
плотности в ряд Фурье и определении разрешения набора гармоник ряда Фурье (в том числе для случаев, когда набор гармоник неполный).
Помимо методов РСА для получения трехмерной структуры белка используется и метод ЯМР. В
четвертом практикуме было изучено, как соотносятся структуры белков, построенных
этими двумя методами.
Также в этом семестре мы изучали алгоритмы, используемые в структурной биологии, на примере задач предсказания элементов вторичной
структуры (практикум 5), поиска гидрофобных кластеров
(практикум 6), построения поверхности белка
(практикум 7) и совмещения структур гомологичных белков
(практикум 8).
Отчет по валидации структуры Cu,Zn-супероксиддисмутазы
1PU0 доступен по ссылке:
pdf.
|
|
© Наталия Кашко, 2017
|