Вкусности стандартной библиотеки

План

• urllib:
  • Простой пример
  • urlencode
  • GET vs POST
  • firebug
  • robots.txt
  • robotparser
  • утки!
• pickle
• StringIO
• copy

Задание

Памятка: задание – то, что обязательно выполнить для получения зачёта; упражнения – необязательные, но как правило задание решить проще, если сначала выполнить все упражнения; если вы меня пнёте, выдам вам комментарии про то, что и как лучше, и по заданию, и по упражнениям.

Упражнения

• ..

• Напишите скрипт get-pfam.py для скачивания выравниваний из PFAM. Скрипт получает accession number выравнивания через параметр -a / --acc, имя выходного файла через параметр -o / --out (при этом если имя файла не задано, в качестве него он использует accession number с добавленным расширением .fasta).