2024
2023
2022
2021
2020
2019
2018
2017
Практикум 1
Материал: структура “вашего” белка (см. семестр 1) и файл с его электронной плотностью.
Задание: построить изображение электронной плотности вокруг полипептидной цепи и трех-пяти аминокислотных остатков, различных по типу (триптофан, лизин, аланин, например). Используйте 2-3 уровня подрезки электронной плотности чтобы оценить качество модели пространственной структуры, представленной в PDB файле.
Форма отчёта: html-страница.
Результат должен включать:
- разрешение структуры
- рисунки электронной плотности с подписями
- заключение о соответствии координат атомов сгущениям электронной плотности на основе полученных рисунков
Подсказки по PyMOL см. на http://kodomo.fbb.msu.ru/wiki/Main/PyMol.