Учебная страница курса биоинформатики,
год поступления 2010
Подсказки к заданиями первого занятия первого блока
Подсказки к заданиям 1-3
Общие
Найти нужный шаблон можно с помощью кнопок Template > Template Window > DNA/RNA Kit.
Пронумеровать атомы можно с помощью кнопки # в режиме Structure. Щелчок по кнопке откроет меню с возможными вариантами нумерации. Если предложенный по умолчанию вариант разумен, то нажмите кнопку ОК. Затем щелкая по атомам в нужном порядке получите желаемую нумерацию. Стереть номера можно с помощью кнопок Tools->Clear Numbering.
Для выделения атомов и/или связей цветом дважды щелкните по выделенному фрагменту. Двойной щелчок вызывает меню Properties, в котором нужно выбрать цвет и нажать кнопку Apply.
Для сдвига или поворота выделенного фрагмента используйте кнопки Select/Move и Select/Rotate в режиме Structure. При повороте выделенного удобно также использовать инструменты Set Bond Vertically/Horizontally.
Прерывистые линии проще нарисовать в режиме DRAW.
Для создания подписей и/или текста комментария перейдите в режим Draw и щелкните по 3-ей кнопке снизу в левом меню-столбце
К отдельным упражнениям
При выполнении упр.1 обратите внимание на то, какое из соединений - нуклеотид, а какое - нуклеозид, а также на то, что уридин и псевдоуридин встречаются обычно в РНК!
Рекомендуемый порядок действий при выполнении упр.2:
- скопируйте на лист в нужном количестве подходящие шаблоны,
- соедините остатки фосфорилированных сахаров, выделите их цветом, (см. выше)
- подпишите основания,
- соедините основания с остовом и надпишите 5' и 3' концы.