Практикум 15 мая
Порядок такой. Докладчик выдвигает гипотезу об эволюции изученной им доменной архитектуры и защищает ее (обосновывает полученными данными). Слушатели стараются опровергнуть гипотезу или предложить другую, укладывающуюся в предложенные данные.
Автоматический зачёт за блок 3 получают:
- докладчик - если преподаватели признали доклад успешным
- студент, успешно оппонировавший докладчику
Оппонентом может быть любой студент. К оппонированию можно подготовиться заранее.
Претендент на доклад должен сообщить до 12 мая включительно о каком домене и каких доменных архитектурах идет речь. Также он должен сообщить гипотезу, которую намерен защитить. (Примеры гипотез: (i) доменная архитектура X образовалась независимо на разных ветвях эволюции домена"; (ii) "доменные архитектуры X и Y были у LUCA")
Удачи нам в проведении такой дискуссии!
Претенденты на доклад
Фамилия |
Имя |
Комментарии |
Порядок выступлений |
Pfam домен (AC) |
Архитектуры |
Защищаемая гипотеза |
Захаров |
Матвей |
все данные на сайте |
|
|
|
Сложная архитектура превращалась в простые несколько раз |
Тахавеев |
Вакиль |
все данные на сайте |
|
|
|
У LUCA была двухдоменная архитектура. С ходом эволюции у D-аминооксидаз и ферментов семейства Глюкоза-метанол-холин оксидаз в этой архитектуре каталитический домен остался прежним, а второй домен стал различаться между двумя данными группами ферментов, породив два новых домена. |
Иванова |
Мария |
|
|
SufE |
(1) SufE (2) SufE--BolA |
У LUCA была однодоменная архитектура, которая осталась у бактерий, а у эукариот домен SufE объединился с доменом BolA в двухдоменную архитектуру. |