Kodomo

Пользователь

Учебная страница курса биоинформатики,
год поступления 2010

Реляционные базы данных, MySQL

Решением каждой задачки является ОДИН запрос.

Для разминки:

  1. Узнать среднюю длину гена для каждого генома. Вывести идентификаторы геномов и среднюю длину генов для каждого из них.
  2. Узнать, сколько в каждом геноме генов, название которых состоит ровно из 3 символов. Вывести идентификаторы геномов и количество таких генов по убыванию количества генов.

Немного посложнее (для решения этих задач вам потребуется запрос с JOIN):

  1. Узнать долю кодирующих последовательностей в геноме c genome_id=191.
  2. Вывести все пары генов для генома c genome_id=191, расстояние между которыми не больше 50.
  3. Вывести CDS у которых UNIPROT ID равен P39404 или P0AFH8 (связка UNIPROT ID и CDS находится в таблице cds_ref).