Задание по структурным классификациям
Привести в файле Name_skills.docx примеры доменов из SCOP или CATH с заданными архитектурами и содержащие заданные структурные мотивы. Отчет должен содержать координаты домена для каждого примера и RasMol или PyMol скрипт, при помощи которого получено изображение. Скрипт должен показывать выделенный домен, выделять в составе структуры найденные элементы архитектуры или найденный структурный мотив (только ядро, то есть core), и изображать их, например, особым цветом.
Заполните таблицу
Название архитектуры или мотива |
Домен |
Скрипт |
ββα-sandwich |
2gjc_A16-326 |
load "2gjc_A16-326.ent" |
β-sandwich |
|
|
βα-sandwich |
|
|
αβα-sandwich |
|
|
β-barrel |
|
|
TIM-barrel |
|
|
β-propeller |
|
|
β-prism |
|
|
β-meander |
|
|
βαβ-motif |
|
|
β-helix |
|
|
Greek key |
|
|
interlock |
|
|
jellyroll |
|
|