Kodomo

Пользователь

Учебная страница курса биоинформатики,
год поступления 2010

Биоинформатика пространственных структур белков и комплексов молекул

Расписание

Результаты (Только для студентов этого года и преподавателей!)

Те студенты, к которым есть вопросы у Е. Аксянова (в Результатах написано "есть вопросы" или что-то подобное) могут поймать меня лично или связаться через Skype, никнейм "tuser.evg".

Список элементарных вопросов

Зачётные задания

ВНИМАНИЕ! Организована очередь работ, ожидающих проверки. Если вы что-то доделали - записывайтесь сюда. Если что-то исправили - снова записывайтесь.

Запись в очередь на проверку Состояние очереди


Экзамен

Лекция 1

С.А. Спирин

[презентация]

Занятие 1. Восстановление окружения молекулы белка в кристалле. Ряд Фурье функции электронной плотности (одномерная модель)

[задания] [методика] [подсказки] [скрипты]

Комментарии по результатам проверки

Лекция 2. Биологическая кристаллография, часть 1

В.Ю.Лунин

[презентация]

Лекция 3. Биологическая кристаллография, часть 2

В.Ю.Лунин

[презентация]

Занятие 3

[задания]

Лекция 4. Биологическая кристаллография, часть 3

В.Ю.Лунин

[презентация]

Занятие 4. Фазовая проблема

[задания] [подсказки]

Лекция 5. Оценка качества 3D структуры белка ("validation")

А.В.Алексеевский

[презентация]

Занятие 5.

[контрольная] [задания]

Лекция 6. Ядерный магнитный резонанс и структуры биомолекул

5 нояб 2013

С.А.Спирин

[презентация]

Занятие 6.

[задания] [указания]

Отчет по качеству РСА расшифровки структуры белка

Отчёт обязателен для получения зачета.

[отчёт] [указания]

Лекция 7. Алгоритмы определения вторичной структуры

6 нояб 2013

Е.А. Аксянов

[презентация] [задания]

Лекция 8. Гидрофобные кластеры. Домены. Поверхность

12 нояб 2013

А.В.Алексеевский

[гидрофобные кластеры] [домены]

Лекция 8. Окончание

13 нояб 2013, 1 час.

С.А.Спирин

[поверхности]

Консультации по коллоквиуму

13 нояб 2013, 1 час.

В понедельник, 18 нояб, в 9 час, в комклассе 207

Коллоквиум

19 и 20 нояб. 2013

[программа]

Лекция 9. Структурные классификации

26 нояб 2013

Е.А. Аксянов

[презентация] [задания]

Лекция 10. Пространственное совмещение

27 нояб 2013

Е.А. Аксянов

[презентация] [задания]

Темы рефератов и докладов

[пояснения] [список]

Рефераты выложены на диске Р: (/home/export/samba/public на kodomo)

В среду, 18 дек доклады начинаются в 11:30

Выбор темы и написание реферата обязательны для всех.

Пояснение по поводу реферата

1. Реферат, который мы от вас ожидаем, - это не подстрочный перевод статьи, пусть даже и с сокращениями. Точные совпадения больших кусков вашего текста с текстом статьи - это не реферат, а плагиат. Такие работы сразу отклоняются.

Допускается использовать цитаты из оригинальной статьи или их перевод. В этом случае, цитаты заключаются в кавычки. После кавычек ставится ссылка на источник цитирования. Разумеется, реферат не должен состоять преимущественно из цитат. Прямое цитирование вообще применяют довольно редко, когда важен не общий смысл, а конкретный текст (ну, например, "автор пишет "цитата" (ссылка), а я считаю, что надо дополнить это определение тем-то и тем-то по такой-то причине") . В подавляющем большинстве случаев цитирование не нужно.

Ваша задача не в том, чтобы аккуратно переписать все упомянутые в статье названия программ, использованные пороги и туманные речевые обороты, заменяющие авторам математические формулы. Вместо этого надо представить выполненное вами описание основных принципов и шагов алгоритма.

Если из статьи что-то непонятно (а так, зачастую, бывает), то не стоит непонятную фразу с английского переводить на русский язык. Можно этот частный вопрос опустить, описать приблизительно, или просто сказать - далее вычисляется то-то и то-то, но как это вычисляется - из статьи понять невозможно.

Простейший способ сделать хороший реферат такой. У вас есть статья. Вы ее прочитали. Отложили в сторону. Открыли ворд. Написали, что запомнили. У вас возникнет какой-нибудь вопрос обязательно. Можно посмотреть в статье. Закрыть статью. Написать своими словами.

Также можно использовать свою презентацию. Вы что-то говорили по поводу первого слайда. Запишите это. По поводу второго. Тоже запишите. И так далее.

Главное во время написания реферата - не открывать исходную статью перед написанием каждого предложения.

2. Ссылки на википедию недопустимы. В научной работе мы не можем ссылаться на этот источник, потому что в нем может кто угодно написать что угодно. Это все-таки научный текст, а не фейсбучная запись. Допустимыми источниками тут являются научные статьи, в крайнем случае - сайты или личные сообщения.

3. Надо писать реферат на понятном русском языке, избегая жаргонизмов, неточных формулировок и некорректных или бессмысленных утверждений.