2024
2023
2022
2021
2020
2019
2018
2017
Биоинформатика пространственных структур белков и комплексов молекул
Результаты (Только для студентов этого года и преподавателей!)
Те студенты, к которым есть вопросы у Е. Аксянова (в Результатах написано "есть вопросы" или что-то подобное) могут поймать меня лично или связаться через Skype, никнейм "tuser.evg".
ВНИМАНИЕ! Организована очередь работ, ожидающих проверки. Если вы что-то доделали - записывайтесь сюда. Если что-то исправили - снова записывайтесь.
Запись в очередь на проверку Состояние очереди
Лекция 1
С.А. Спирин
Занятие 1. Восстановление окружения молекулы белка в кристалле. Ряд Фурье функции электронной плотности (одномерная модель)
[задания] [методика] [подсказки] [скрипты]
Комментарии по результатам проверки
Лекция 2. Биологическая кристаллография, часть 1
В.Ю.Лунин
Лекция 3. Биологическая кристаллография, часть 2
В.Ю.Лунин
Занятие 3
Лекция 4. Биологическая кристаллография, часть 3
В.Ю.Лунин
Занятие 4. Фазовая проблема
Лекция 5. Оценка качества 3D структуры белка ("validation")
А.В.Алексеевский
Занятие 5.
Лекция 6. Ядерный магнитный резонанс и структуры биомолекул
5 нояб 2013
С.А.Спирин
Занятие 6.
Отчет по качеству РСА расшифровки структуры белка
Отчёт обязателен для получения зачета.
Лекция 7. Алгоритмы определения вторичной структуры
6 нояб 2013
Е.А. Аксянов
Лекция 8. Гидрофобные кластеры. Домены. Поверхность
12 нояб 2013
А.В.Алексеевский
[гидрофобные кластеры] [домены]
Лекция 8. Окончание
13 нояб 2013, 1 час.
С.А.Спирин
Консультации по коллоквиуму
13 нояб 2013, 1 час.
В понедельник, 18 нояб, в 9 час, в комклассе 207
Коллоквиум
19 и 20 нояб. 2013
Лекция 9. Структурные классификации
26 нояб 2013
Е.А. Аксянов
Лекция 10. Пространственное совмещение
27 нояб 2013
Е.А. Аксянов
Темы рефератов и докладов
Рефераты выложены на диске Р: (/home/export/samba/public на kodomo)
В среду, 18 дек доклады начинаются в 11:30
Выбор темы и написание реферата обязательны для всех.
Пояснение по поводу реферата
1. Реферат, который мы от вас ожидаем, - это не подстрочный перевод статьи, пусть даже и с сокращениями. Точные совпадения больших кусков вашего текста с текстом статьи - это не реферат, а плагиат. Такие работы сразу отклоняются.
Допускается использовать цитаты из оригинальной статьи или их перевод. В этом случае, цитаты заключаются в кавычки. После кавычек ставится ссылка на источник цитирования. Разумеется, реферат не должен состоять преимущественно из цитат. Прямое цитирование вообще применяют довольно редко, когда важен не общий смысл, а конкретный текст (ну, например, "автор пишет "цитата" (ссылка), а я считаю, что надо дополнить это определение тем-то и тем-то по такой-то причине") . В подавляющем большинстве случаев цитирование не нужно.
Ваша задача не в том, чтобы аккуратно переписать все упомянутые в статье названия программ, использованные пороги и туманные речевые обороты, заменяющие авторам математические формулы. Вместо этого надо представить выполненное вами описание основных принципов и шагов алгоритма.
Если из статьи что-то непонятно (а так, зачастую, бывает), то не стоит непонятную фразу с английского переводить на русский язык. Можно этот частный вопрос опустить, описать приблизительно, или просто сказать - далее вычисляется то-то и то-то, но как это вычисляется - из статьи понять невозможно.
Простейший способ сделать хороший реферат такой. У вас есть статья. Вы ее прочитали. Отложили в сторону. Открыли ворд. Написали, что запомнили. У вас возникнет какой-нибудь вопрос обязательно. Можно посмотреть в статье. Закрыть статью. Написать своими словами.
Также можно использовать свою презентацию. Вы что-то говорили по поводу первого слайда. Запишите это. По поводу второго. Тоже запишите. И так далее.
Главное во время написания реферата - не открывать исходную статью перед написанием каждого предложения.
2. Ссылки на википедию недопустимы. В научной работе мы не можем ссылаться на этот источник, потому что в нем может кто угодно написать что угодно. Это все-таки научный текст, а не фейсбучная запись. Допустимыми источниками тут являются научные статьи, в крайнем случае - сайты или личные сообщения.
3. Надо писать реферат на понятном русском языке, избегая жаргонизмов, неточных формулировок и некорректных или бессмысленных утверждений.
[указания]