Kodomo

Пользователь

Учебная страница курса биоинформатики,
год поступления 2012

Задание

1. (1б) Построить график случайного блуждания с входными параметрами – количество шагов, вариация и заданный порог t. Если кривая пересекает порог t (горизонтальную ось y=t), то нарисовать вертикальную линию из точки пересечения на ось x. Подсказка: вертикальную линию можно изобразить с помощью функции vlines(…)

2. (1.5б) Входные параметры как и в предыдущей задаче. Построить гистограмму расстояний (количества шагов) между двумя событиями пересечения пороговой линии (y=t).

3. (2б) Дан набор последовательностей в fasta файле (ls_orchid.fasta), построить scatter plot зависимости GC-состава последовательностей от длины. Подсказка: Длину последовательностей и GC-состав можно быстро узнать с помощью пакета biopython.