2024
2023
2022
2021
2020
2019
2018
2017
Нахождение гидрофобных кластеров
1.Найдите гидрофобные кластеры в структуре какого-либо белка
Используйте CluD: http://mouse.belozersky.msu.ru/npidb/cgi-bin/hftri.pl (к сожалению Jmol online нынче запустить почти невозможно, используйте текстовую выдачу).
- Меняйте параметры: порог расстояния и порог размера кластера, чтобы получить лучше интерпретируемый результат.
- Опишите соответствие кластеров доменам и субдоменам белка, определяемым визуально или как-либо иначе.
2. Найдите гидрофобные кластеры на интерфейсе двух цепочек в структуре какого-либо белкового димера (или комплекса белка с ДНК)
Опишите результат.