2024
2023
2022
2021
2020
2019
2018
2017
Язык R и его применение в биоинформатике
[https://www.rstudio.com/products/rstudio/|RStudio]]
Система для выполнения домашних заданий После регистрации пишите на fbbrcourse [собака] gmail.com, чтобы мы добавили вас в группу, тогда станут доступны домашние задания.
Занятия
1. 1 сентября. Введение. Знакомство с R-Studio. Базовый тип - вектор, dataframe. Графики.
[лекция1]
2. 8 сентября. Графика. Отсутствующие данные. Матрицы. Списки.
3. 22 сентября. Факторы. Файлы. Статистика.
[лекция3]
4. 29 сентября. Манипуляции с данными, dplyr. Создание отчетов, markdown
[лекция4]
5. 6 октября. Тесты ассоциации, GWAS. if, for, apply, merge
6. 13 октября. Преобразование данных (reshape2). Графика (ggplot2). Чистка данных.
7. 20 октября. Линейные модели часть 1
8. 27 окт. Контрольная работа
9. 3 ноя. Линейные модели часть 2
Датасет - паттерны эпигенетических модификаций в промоторах и энхансерах
10. 10 ноя. Множественное тестирование, кластеризация.
11. 17 ноя. Методы понижения размерности.
12. 24 ноя. Классификаторы.
[ Лекция - SVM ]
13. 1 декабря. BioconductoR, дифференциальная экспрессия по данным RNA-seq
14. 8 декабря Gene Ontology. Технология Shiny.
15. 15 декабря. Контрольная работа 2 [Файлы к контрольной работе]