2024
2023
2022
2021
2020
2019
2018
2017
Практические занятия к курсу "Молекулярное Моделирование Биополимеров"
Новые варианты лекций вместе с исходной разметкой в LaTex (без) можно посмотреть тут: http://kodomo.fbb.msu.ru/~golovin/mmlectures/
Правила сдачи зачёта
Связи с тем, что практикум предполагает использование суперкомпьютера и время доступа ограничено, то ожидается, что к этому моменту студенты будут знакомы с материалом. Для достижения этого результата необходим контроль за исполнением заданий. Итак:
- Если сумма баллов за практикумы менее 0.666 от максимальной, то студент получает дополнительнo на зачёте.
Жду рациональных предложений по улучшению курса.
Результаты практической работы
Результаты доступны в виде google таблицы. Из таблицы видно как оцениваются задания.
1. Знакомство с Pymol
15 февраля 2019, А.В.Головин. [задания] [презентация]
2. Работа Pymol
22 февраля 2019, А.В.Головин. [задания]
3. Хемоинформатика
15 марта 2019, А.В.Головин. [задания]
4. Ab initio вычисления орбиталей водорода
19 марта 2019, А.В.Головин. [задания]
5. Ab initio вычисление молекулы водорода
22 марта 2019, А.В.Головин. [задания]
6. Вычисление ковалентных параметров для молекулярной механики
30 марта 2019, А.В.Головин. [задания]
7. Изучение работы методов контроля температуры в молекулярной динамике
5 апреля 2019, А.В.Головин. [задания]
8. Гомологичное моделирование комплекса белка с лигандом
12 апреля 2019, А.В. Головин [задания]
9. Докинг низкомолекулярных лигандов в структуру белка
19 апреля 2019, А.В. Головин [задания]
10. Макромолекулярный докинг
26 апреля 2019, А.В. Головин [задания]
11. Молекулярная динамика биологических молекул в GROMACS
26 апреля 2019, А.В. Головин [задания]
9. Анализ молекулярной динамики биологических молекул в GROMACS
17 мая 2019, А.В. Головин [задания]
5. Полуэмпирические и Ab initio вычисления молекулярных систем
23 марта 2018, А.В.Головин. [задания]
6. Вычисление ковалентных параметров для молекулярной механики
30 марта 2018, А.В.Головин. [задания]
7. Изучение работы методов контроля температуры в молекулярной динамике
6 апреля 2018, А.В.Головин. [задания]
8. Гомологичное моделирование комплекса белка с лигандом
13 апреля 2018, А.В. Головин [задания]
9. Докинг низкомолекулярных лигандов в структуру белка
20 апреля 2018, А.В. Головин [задания]
10. Макромолекулярный докинг
27 апреля 2018, А.В. Головин [задания]
11. Молекулярная динамика биологических молекул в GROMACS
4 мая 2018, А.В. Головин [задания]
12. Анализ молекулярной динамики биологических молекул в GROMACS
11 мая 2018, А.В. Головин [задания]