2024
2023
2022
2021
2020
2019
2018
2017
Напишите мини-обзор генома вашей бактерии или археи
Формат
- Мини-обзор на русском языке в формате .pdf должен быть доступен по ссылке с веб-страницы "Excel".
- Форматирование должно соответствовать требованиям журнала. Выбор журнала - за вами.
- Мини-обзор должен включать, как минимум, один рисунок (гистограмма - рисунок) и одну таблицу.
- Все результаты должны быть получены с помощью средств Excel (или аналогов).
- Должен быть раздел или подраздел "Сопроводительные материалы", содержащий ссылку на ваш Excel файл
Обязательные результаты для включения в мини-обзор
- Число генов белков и генов РНК по категориям (транспортные, рибосомальные, другие). Примерная оценка числа генов на 1 млн пар нуклеотидов (п.н.).
- Гистограмма длин белков из протеома своей бактерии или археи.
- Таблица числа генов белков и генов РНК на прямой и комплементарной цепочках ДНК.
Дополнительные (не обязательные для включения в отчет) результаты
- Проверьте гипотезу о том, что гены распределены по цепочкам случайно с вероятностями 0,5.
- Посчитайте, сколько "квазиоперонов" в геноме вашей бактерии или археи.
- Представьте статистические данные о пересечениях генов (если таковые обнаружатся).
- (Самое важное и трудное) Представьте статистику белков по категориям достоверности их существования.
Содержание отчета
Заголовок (Title) Придумайте сами. Например, "Обзор протеома бактерии ..."
Автор - это Вы
Резюме (Abstract) Краткое описание работы. Должно быть написано так, чтобы было более менее понятно, что, для чего и как вы делали, и что получилось.
Введение (Introduction) Задача данного раздела – ввести читателя в курс дела и объяснить, для чего была сделана работа. Объяснение типа "Нам задали написать обзор" - не то, что требуется.
В этом разделе стоит написать коротко что известно про бактерию и/или про ее геном, обязательно со ссылками на источники!
Материалы и методы (Materials and methods) Описание использованных инструментов, источников исходных данных и другая информация, необходимая для воспроизведения результатов.
В вашем случае надо упомянуть Excel, можете написать, какими функциями вы пользовались и для чего. Ну и конечно написать, откуда скачивали исходные файлы.
Все очень коротко.
Результаты (Results) Подробное описание ваших результатов, ссылки на таблицы и картинки. Может включать подразделы. Например, у вас, скорее всего, будет подраздел про распределение длин белков и подраздел про распределение генов по цепям.
Обсуждение (Discussion) Обсуждение полученных результатов, того, как они вписываются в картину мира. Часто раздел содержит гипотезы и теории автора, которые они предлагают для объяснения результатов.
Вам, конечно, нужно обсудить, какие выводы вы можете сделать из таблиц и гистограмм. Напишите, белки какой длины встречаются чаще всего. Опишите особенности распределения белков по длинам, которые показались вам интересными/удивительными/странными. Ваши суждения об распределении генов по цепям ДНК. Все, что найдете интересного!
Заключение (Conclusion) Краткое заключение. Можете опустить, если что-то похожее есть в конце обсуждения.
Сопроводительные материалы (Supplementary materials) Ссылка на файл .xls(x), в котором приведены все расчеты. Оформление файла должно быть понятно читателям!
Благодарности (Acknowledgments) Обычно благодарят тех, кто помогал в работе, в подготовке публикации, или спонсировал исследования.
Список литературы (References) Список ссылок на статьи, книги, сайты и др., которые были использованы (упоминались) в тексте.