2024
2023
2022
2021
2020
2019
2018
2017
Методические указания
- Не исключаю, что в вашем выравнивании окажутся либо слишком похожие последовательности, либо, наоборот, окажется последовательность с малым сходством с остальными. Я ожидаю, что и первого, и последнего случая в выравнивании не будет. Но исключить такие случаи не могу, учитывая что у вас мало опыта. Поэтому при выборе пары последовательностей исключите крайности!
Подсказки по команде EMBOSS можно получить так (на примере): needle -help -verbose. Указание про формат выходного выравнивания ищите в разделе "outfile" assotiated parameters. Значения штрафов за гэпы, за концевые гэпы, какая матрица весов используется см. в разделах Standard qualifiers и Additional qualifiers.