Kodomo

Пользователь

Тема PWM

Вычислить позиционную весовую матрицу (PWR) по указанному выравниванию.

Дан геном коронавируса и координаты инициаторных кодонов генов.

Надо получить последовательности окрестности - четыре нуклеотида до ATG и два после. ATG должно быть включено в последовательность.

Составить из них выравнивание (т.е. поставить друг под другом - без всяких программ)

Вычислить самостоятельно PWM для полученного выравнивания, т.е. последовательности Козак.

Даётся 1 час времени.

Результат прислать ААл по почте. Из присланных данных должен быть понятен ход вычислений. Только ответ - не принимается.

  1. снят
  2. [геном] [таблица координат ATG]

  3. [геном] [таблица координат ATG]

  4. [геном] [таблица координат ATG]

  5. [геном] [таблица координат ATG]