2024
2023
2021
2020
2019
2018
2017
2016
Занятие 7. Базы данных KEGG и GO
Мягкий дедлайн: 26 апреля в 23:59
Жесткий дедлайн: 3 мая в 23:59
Возьмите свой список listID (каждый файл назван как Login.txt).
[ Списки ID ]
Выберите две базы данных/сервиса (или больше, на ваш вкус, мне не жалко бонусных баллов): GO, STRING, Human Protein Atlas, KEGG, Reactome, GeneCards, Panther
Проанализируйте свой список ID или один ID из списка с помощью выбранной базы данных/сервиса.
В качестве отчета оформите страницу на kodomo в виде СВЯЗНОГО ТЕКСТА с иллюстрациями.
Не стесняйтесь проявлять свою фантазию и испытывать мое чувство юмора.
В отчете должна быть представлена вся необходимая информация для понимания сути и цели исследования.
В отчете:
- кратко опишите входные данные
- опишите анализ, который вы задумали сделать
- краткие возможности базы данных/сервиса (что можно с его помощью сделать, на какие вопросы ответить, какую информацию получить, ...) и какие возможности выбранной базы данных вы использовали
- какие результаты вы получили
- проиллюстрируйте результаты, если возможности выбранного ресурса это позволяют
- все полученные результаты должны быть обсуждены - ЭТОТ пункт САМЫЙ главный, мне нужны ВАШИ мысли по поводу сделанного
Оцениваться будет качество вашего отчета, связность и осмысленность обсуждения результатов.
* В качестве бонусного задания возьмите один ID и проанализируйте его средствами Genome Browser
Постарайтесь отнестись к заданию, как к возможности ознакомиться с разными ресурсами, проявить научную самостоятельность и узнать что-то новое и интересное.
Коллеги, цель задания - проанализировать список генов и понять, в каком процессе они участвуют, а не рекламировать сервисы.))
Если у вас не получилось найти значимого обогащения терминами, напишите преподавателям, мы дадим другой список ID.
При возникновении трудностей не стесняйтесь нам писать.