Задания к лекциям 3 и 4
Ответы присылайте мне (Сергей Алексанлрович Спирин, sas 'at' belozersky.msu.ru ). Можно сделать только одно, два или все три задания.
Определите, последовательность какого участка какого белка приведена на слайде 28 ("Глобулярный белок") презентации.
Указания.
Используйте сервис BLAST на сайте Uniprot.
- В окно скопируйте последовательность
- В качестве банка (“Target database”) укажите “UniprotKB/Swiss-Prot” (16-ый сверху в списке банков).
- На странице с результатом ищите белок (белки) со 100% сходством.
- Выберите один такой белок (если их несколько) и пройдите по гиперссылке View alignment. Найдите координаты начала и конца участка белка.
- Какой белок человека имеет участок, наиболее близкий к данному участку? Каковы координаты этого участка, каков процент сходства на нём? Какие аминокислотные замены имеются в последовательности человеческого белке по сравнению с данной последовательностью?
Проделайте задания 1–2, используя сервис BLAST на сайте NCBI или же на сайте EBI, поиск по Swiss-Prot. Составьте указания по использованию этого сервиса, аналогичные указаниям к заданию 1.