|
|
|
|
|
|
Практика №6: Пакет EMBOSS.
Программы парного выравнивания
1. Определить вес выравнивания.
2.
Вопрос: Совпало ли выравнивание с построенным вами?10 20
seq1 FHIEEIDL-THLTGSEQTAKI
: :::: : : :::: ::.
seq2 FGIEEIILWTKHVGSEQMAKM
10 20
Ответ: Выравнивание не совпало, в нем намного меньше гэпов.
Вес этого выравнивания - 41, это сильно отличается от выравнивания выше.
3.
a) В частичное выравнивание вошли следующие участки последовательностей:
моего белка – 131-1178
родственного белка 122-1196
b) Вес полного выравнивания 820.0
Вес частичного выравнивания 868.0
Параметры были одинаковы.
Частичное выравнивание обычно по весу больше полного, так как есть «возможность выбора» "хорошего" участка
|