ГАВРИШ ОЛЬГАФББ - 1 курс - группа 102 |
|
Практика №11: Программа MEME.1. Программа MEME нашла три мотива:Ссылка на файл 1. Первый мотив нашелся во всех последовательностях. Координаты моей последовательности:606-631 P-value для моей последовательности: 1.61e-28 Длина выравнивания: 26 E-value: 1.1e-057 2. Второй мотив нашелся в 7 из 10 последовательностях Координаты моей последовательности: 805 -822 P-value для моей последовательности: 2.76e-17 Длина выравнивания: 18 E-value: 7.8e-008 3. Третий мотив нашелся во всех последовательностях Координаты моей последовательности: 941-955 P-value для моей последовательности: 2.17e-11 Длина выравнивания: 15 E-value: 3.3e-003 2. Сравнение блоков (частичных выравниваний), найденных MEME, c полным выравниванием, выданным muscleСсылка на картику Первый мотивы, найденный MEME, полностью выровнены программой muscle. Во втором и третьем мотивах есть неточности - например, во втором мотиве почти все белки "разъехались" из-за гэпов, кроме первого. В третьем тоже есть "вставки" из гэпов. 3.Ссылка на Must Результат очень огорчает. Мотивы нашлись в следующих количествах: первый: 2/13 второй: 1/13 третий: 3/13 Возможно, Mast вывел только первые несколько позиций, но почему - не понятно. Все мотивы не нашлись ни в одной из последовательностей. |
|
© by OlGavrish, 2010 |