PubMed

PubMed

По заданию мне достался белок с названием Bax.

История моих запросов PubMed:

Запрос	Запрос как его понял PubMed из Search details	Всего находок	Всего в открытом доступе	Всего обзоров
bax	bax[All Fields]	20819	7458	20121
bax[title]	bax[title]	3226	1326	3143
bax[title] 2012[publication date]	bax[title] AND 2012[publication date]	215	65	207
bax[title] role	bax[title] AND ("role"[MeSH Terms] OR "role"[All Fields])	957	408	953
bax[title] 2008[publication date]	bax[title] AND 2008[publication date]	269	115	268
bax regulation cell process	bax[All Fields] AND ("social control, formal"[MeSH Terms] OR ("social"[All Fields] AND "control"[All Fields] AND "formal"[All Fields]) OR "formal social control"[All Fields] OR "regulation"[All Fields]) AND ("cell physiological phenomena"[MeSH Terms] OR ("cell"[All Fields] AND "physiological"[All Fields] AND "phenomena"[All Fields]) OR "cell physiological phenomena"[All Fields] OR ("cell"[All Fields] AND "process"[All Fields]) OR "cell process"[All Fields])	5531	2089	5518
bax[title] regulation cell process	bax[title] AND (("social control, formal"[MeSH Terms] OR ("social"[All Fields] AND "control"[All Fields] AND "formal"[All Fields]) OR "formal social control"[All Fields] OR "regulation"[All Fields]) AND ("cell physiological phenomena"[MeSH Terms] OR ("cell"[All Fields] AND "physiological"[All Fields] AND "phenomena"[All Fields]) OR "cell physiological phenomena"[All Fields] OR ("cell"[All Fields] AND "process"[All Fields]) OR "cell process"[All Fields]))	881	393	871
bax[title] regulation[title] cell process	bax[title] AND regulation[title] AND ("cell physiological phenomena"[MeSH Terms] OR ("cell"[All Fields] AND "physiological"[All Fields] AND "phenomena"[All Fields]) OR "cell physiological phenomena"[All Fields] OR ("cell"[All Fields] AND "process"[All Fields]) OR "cell process"[All Fields])	121	61	120
	related citation (Bax inhibitor-1 enhances survival and neuronal differentiation of embryonic stem cells via differential regulation of mitogen-activated protein kinases activities.)	103
bax[title] regulation[title] activity	bax[title] AND regulation[title] AND ("motor activity"[MeSH Terms] OR ("motor"[All Fields] AND "activity"[All Fields]) OR "motor activity"[All Fields] OR "activity"[All Fields])	38	19	38
bax[title] regulation[title] function activity	bax[title] AND regulation[title] AND (("physiology"[Subheading] OR "physiology"[All Fields] OR "function"[All Fields] OR "physiology"[MeSH Terms] OR "function"[All Fields]) AND ("motor activity"[MeSH Terms] OR ("motor"[All Fields] AND "activity"[All Fields]) OR "motor activity"[All Fields] OR "activity"[All Fields]))	36	19	36
bax[title] regulation[title] function[title] activity	bax[title] AND regulation[title] AND function[title] AND ("motor activity"[MeSH Terms] OR ("motor"[All Fields] AND "activity"[All Fields]) OR "motor activity"[All Fields] OR "activity"[All Fields]) AND "loattrfree full text"[sb]	1	1	1
signal cascade bax 2012[publication date]	((signal[All Fields] AND cascade[All Fields] AND bax[All Fields]) AND 2012[publication date]) AND "loattrfree full text"[sb]	22	1	22

В результате самым оптимальным является запрос bax[title] regulation[title] activity.

Ссылка на мою персональную коллекцию публикаций на заданную тему в PubMed:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/myncbi/collections/public/1nMwwN7K_Z6FCkEzRt-JDx25P/

Open acsess статья, которую я выбрала для краткого описания:

Regulation of stress-induced nuclear protein redistribution: a new function of Bax and Bak uncoupled from Bcl-xL (pubmed 19816507)

Это исследование представляет новую функцию белков Bax и Bak, а именно, регулирование вызванного стрессом перераспределения ядерных белков, процесс, играющий важную роль в апоптозе Эта функция Bax и Bak отличается от их канонической деятельности по перфорации внешней мембраны митохондрии и высвобождения цитохрома c, потому что она не блокирована гиперэкспрессией Bcl-xL и, видимо, не связана с изменением конформаций N-концов Bax и Bak.

Как пишут сами исследователи, "Мы сосредоточились на перераспределении трех ядерных белков, а именно, NPM, H1 и нуклеолина в ответ на четыре различных стимула апоптоза (цисплатин, камптотецин, доксорубицин и стауроспорин). Во всех случаях мы обнаружили перераспределение этих белков. Этот эффект наблюдался почти сразу после стимулирования апоптоза. Например, существенное перераспределение ядерных белков стало видно через 9 часов после обработки цисплатином или камптотецином, когда транслокация фосфатидилсерина, NT экспозиция Bax/Bak, активация цитохрома c или каспазы-3 еще не были обнаружены." Эти результаты объясняют почему эффект перераспределения не зависел от Apaf-1/каспаза-9 апоптосомы и каспаз вообще, так как эти компоненты, как известно, активизируются позже. Все результаты предполагают, что эффект перераспределения возникает перед или независимо от митохондриального пути.

Оба результата исследования, по словам ученых, были неожиданны. Во-первых, ядерное перераспределение было управляемо Bax или Bak, но произошло прежде, чем клетки показали участие этих белков. Оба процесса могут даже ингибировать друг друга, потому что вероятность того, что перераспределение ядерных белков может наблюдаться вместе с участием Bax/Bak в той же клетке, была ниже, чем ожидалось в случае, что эти два события были случайны. Во-вторых, ядерное перераспределение не ингибировалось гиперэкспрессией Bcl-xL.

Хотя есть убедительное свидетельство того, что главное действие Bax и Bak – перфорирование внешней мембраны митохондрии, ингибируемое Bcl-2/Bcl-xL, другой принцип работы также может существовать для этих двух белков. Результаты позволяют предполагать, что Bax и Bak могут также способствовать апоптозу, регулируя ядерное перераспределение белка, и что этот эффект мог бы быть установлен новым, неизвестным сигнальным путем.

Использованные методы:

За день до трансфекции клетки высевали при плотности 105 клеток на лунку в 12-луночные планшеты. Тогда трансфекции были проведены при наличии Boc, он был добавлен через 5 часов после добавления реагентов для трансфекции. После обработки клетки были зафиксированы и были окрашены различными антителами и красителем Hoechst 33258. Затем клетки инкубировали с первичными антителами. Анализ жизнеспособности клеток: His-GFP-annexin-V/PI FACS анализы. После 24 часов клетки обрабатывали апоптозным веществом (25 мМ цисплатин, 1 мМ камптотецин, 1 мМ доксорубицин или 100 нМ стауроспорин). Для оценки апоптоза His-GFP-annexin-V/PI маркировка выполнена с незначительными изменениями.

Краткое описание сигнального каскада, в котором принимает участие белок Bax:

Согласно данным Uniprot [2], данный белок принимает участие в важных процессах апоптоза, в том числе является участником каспазного сигнального пути.

Рис. 1. Схема каспазного сигнального пути. Белок Bax влияет непосредственно на митохондрии. [1]

Каскад каспазы может быть активирован:

Гранзимом B (выпускает цитотоксические Т-лимфоциты и NK-клетки), который активирует каспазы -3 и -7
Рецепторами смерти (например, Fas, TRAIL рецепторами и рецепторами TNF), которые могут активировать каспазы -8 и -10
Апоптосомой (регулируется цитохромом С и Bcl-2), которая активирует каспазу-9.

При подготовке использованы следующие материалы: