Сравнительный             анализ геномов

Anna Zheltova

First term (Первый семестр):

Protein(Белок)

Archaea (Архея)

Virus (Вирус)

Comparative analysis of the genomes (Сравнительный анализ геномов)

Блок Excel

Homepage (Главная страница)

Сравнительный анализ геномов вируса, бактерии, и млекопитающего.

Информация о геномах организмов.

Организм Число хромосом. Гомологичные хромосомы - от папы и от мамы - считать за одну. Число молекул ДНК в клетке. Гомологичные хромосомы считать за разные Есть ли другие ДНК. Число генов. Длина генома, п.н.
Вирус Tobacco vein banding mosaic virus 1 0 (1 молекула РНК) нет 2 9570
Архея Methanopyrus kandleri 1 0 (1 молекула РНК) нет 1729 1694969
Млекопитающее Rattus norvegicus 22 42 митоходри-
альная
25000 2,75 млрд.

Как следует из таблицы, для существования вируса достаточно 2 гена. Архее достаточно около 1800 генов. Крысе нужно на 4 порядка больше генов, чем вирусу.

Длины геномов археи и млекопитающего в геномах вируса:

Длина генома археи равна 177 геномам вируса (значение выражения 1694969/9570 округлено до целого числа).

Длина генома крысы равна 287356 геномам вируса (значение выражения 2750000000/9570 округлено до целого числа).

Пусть расстояние между соседними парами нуклеотидов равно 3.4*10-10м. Тогда, если развернуть молекулы РНК (или ДНК) и измерить длину, то:

Длина генома вируса 9570 bp * 3.4*10-10м =3,25 *10-6м.

Длина генома бактерии 1694969 bp * 3.4*10-10м = 5,76*10-4м.

Длина генома крысы 2750000000 bp * 3.4*10-10м = 0.935м.

Ссылки:

NCBI

© 2014 Anna Zheltova (Анна Желтова)