Вирус

Anna Zheltova

First term (Первый семестр):

Protein(Белок)

Archaea (Архея)

Virus (Вирус)

Comparative analysis of the genomes (Сравнительный анализ геномов)

Блок Excel

Homepage (Главная страница)

Вирус Tobacco vein banding mosaic virus.

Вирус табачной мозайки

Микрофотография
вируса табачной мозайки [2]

Русское название: вирус табачной мозайки, окаймляющей жилки.

Информация о хозяине вируса.

Вирус инфицирует растения рода Nicotiana (Табак). Это род многолетних и однолетних растений семейства Паслёновые (Solanaceae). Содержит никотин, культивируется как наркотическое средство, вызывающее кратковременную эйфорию.Растение табака ещё в XVI веке было названо Nicotiana в честь Жана Нико (фр. Jean Nicot, 1530—1600), французского посла в Португалии. В середине XVIII века это название было использовано Карлом Линнеем в его работах. [3]

Биологическое описание растения-хозяина.

Корень длинный, до двух метров, стержневой. Стебель табака прямой, округлый, разветвленный. Листья крупные, черешковые или сидячие, цельные, заостренные. Соцветие — метельчатое, щетковидное, цветы пятерного типа. Плод — многосемянная коробочка. [3]

Особенности существования и взаимоотношения с хозяином.

Данный вирус относится к роду Potyvirus. Репликация может происходить в цитоплазме, ядре, хлоропласах, аппарате Гольджи, вакуолях или реже в других необычных местах. Его геном состоит из РНК, которая окружена белковой оболочкой (капсидом). Вирус индуцирует образование цилиндрических белковых включений («флюгеров») в зараженных клетках растений. Эти включения можно увидеть в световом микроскопе. [1] [4]

По типу носителя вирус относится к классу ssRNA positive-strand viruses, no DNA stage. (Тип наследственного материала - одноцепочечная молекла РНК. Вирус с плюс-цепью, т.е. геном , переносимый вирусом, транслируется в белок и его депротеинизированная нуклеиновая кислота существенна для инициации инфекции.)

Описание генома из записи банка Refseq.

Идентификатор записи банка RefSeq: NC_009994 .

Содержание записи: последовательность полного генома.

Длина последовательности генома: 9570 нуклеотидов.

Гены в геноме вируса.

Одноцепочечная РНК вируса содержит два гена (Рис1.).

Ген TVBMV_gp1: длина - 9240 bp, координаты - 147..9386, имеет прямое направление; Продукт - polyprotein (YP_001552409.1): длина -3079 аминокислотных остатка.

Ген TVBMV_gp2: длина - 180 bp, координаты - 2912..3091, имеет прямое направление; Продукт - PIPO (YP_006405418.1): длина - 59 аминокислотных остатков.

Расположение генов в геноме

Рис.1 Расположение генов в геноме Tobacco vein banding mosaic virus. Рисунок получен с помощью геномного браузера сайта NCBI. Исходное изображение. [5]

Ген TVBMV_gp2 находится внутри гена TVBMV_gp1.

Область начала второго гена

Рис.2 Фрагмент генома Tobacco vein banding mosaic virus. Область начала второго гена. Рисунок получен с помощью геномного браузера сайта NCBI. Исходное изображение. [5]

Область конца второго гена

Рис.3 Фрагмент генома Tobacco vein banding mosaic virus. Область конца второго гена. Рисунок получен с помощью геномного браузера сайта NCBI. Исходное изображение. [5]

Ссылки:

1. Potyvirus

2. Вирус табачной мозаики

3. Табак

4. ISTV

5. NCBI

© 2014 Anna Zheltova (Анна Желтова)