Anna Zheltova
Visualization of molecules (Визуализация молекул)
Innards of proteins (Внутренности белков)
Hydrogen bonds between the protein and DNA (Водородные связи между белком и ДНК)
Search in databases (Поиск в базах данных)
Alignment and homology (Выравнивание и гомология)
Predicting the pairwise alignment (Предсказание парных выравниваний)Базы данных.
1. Идентификаторы в разных базах данных
| База данных | Идентификатор |
| Uniprot | ID: Q8TXI8_METKA | AC: Q8TXI8 |
| RefSeq | NP_613970.1 |
| Uniref50 | UniRef50_Q8TXI8 |
| PDB | - |
2. Изменения в записи Uniprot;
Сравниваются версия 1 (01.06.2002) и версия 82 (11.03.2015). Изменился идентификатор записи в базе Uniprot, добавились новые штаммы археи. 1 июня 2002 года запись была интегрирована в UniProtKB/TrEMBL.
В запись добавлено 27 новых ссылок, содержащих идентификаторы белка в других базах данных.
3. Для моего организма гомологов не нашлось, поэтому я анализировала Yersinia pestis.К данному кластеру был добавлен белок с известной структурой (AC Uniprot: Q5JE33, PDB: 4QIW). Excel файл с анализом записей.
Все белки Yersinia pestis имеют одинаковую длинну, отличающуюся от белка из блока 1, их protein existence (данные, свидельствующие о существовании белка), показывают, что оно определяется из гомологии.
4. В строчке FT указаны специфические особенности белка. Например в Solanum lycopersicum (Tomato) (Lycopersicon esculentum). указано существование четырех дисульфидных связей.
