Описание вируса Human enterovirus B.

По типу носителя генома вирус Human enterovirus B (Энтеровирус человека B) классифицируется как вирус без стадии ДНК, имеющим РНК-геном положительной полярности, таксономическое положение вируса:
семейство Picornaviridae,
отряд Picornavirales,
род Enterovirus,
вид Human enterovirus B.

Хозяином вируса, как и следует из названия, является человек.

Геном этого вируса состоит из одной молекулы РНК. Суммарный размер генома в парах нуклеотидов равен 7389. В геноме закодирован один ген. Информация о гене приведена в Таблице 1.

Таблица 1 Гены из генома вируса Human enterovirus B
(идентификатор AF 524867)

Длина гена делится на 3. Графическое изображение всего гена приведено на Рис.1 . Интересно отметить, что на Рис.1 видны два «гена». На самом деле «ген», выделенный синий цветом - это экзотический способ показать, что геном представлен РНК.

Рис. 1. Ген вируса Human enterovirus B (идентификатор записи RefSeq NC_040958.1). Рисунок получен с помощью геномного браузера на сайте NCBI (http://www.ncbi.nlm.nih.gov)

Рис.2. 5’-концевой фрагмент гена. Первый кодон – ATG. Он соответствует аминокислотному остатку метионина (M). Рисунок получен с помощью геномного браузера на сайте NCBI (http://www.ncbi.nlm.nih.gov)

Интересно отметить, что транспозаза, синтезируемый на матрице вирусной РНК, на деле является полипротеином и после синтезирования режется на отдельные части, причем с 5’ конца расположены белки капсида, а после них уже белки, которые нужны после проникновения.
Также интересно, что изучение данного вируса имеет важное практическое значение, так он считается одним из вирусов, заболевание которым многократно увеличивает риск заболевания сахарным диабетом. Так, в его геноме можно найти домен IRES Picoma, этот домен нужен для более эффективной трансляции РНК в клетках поджелудочной железы^[1].

Источники:

[1]  http://en.wikipedia.org/wiki/Picornavirus_internal_ribosome_entry_site_(IRES))