2 семестр
Во втором семестре мы знакомимся с основами HTML, а также структурной биологией.
Отчет по структуре PDB 3FFU
1. Структура в целом
Рисунок 1. Общий вид структуры 3FFU (cartoon). Цепь А окрашена красным цветом, цепь В - синим цветом.
| Тип макромолекул | Белок (гидролаза) |
|---|---|
| Количество полимерных цепей | 2 цепи: A и B (идентичны по последовательности) |
| Биологическая единица | Димер из двух цепей (A и B) |
| Организм | Bdellovibrio bacteriovorus (штамм HD100) |
2. Вторичная структура
Рисунок 2. Вторичная структура белка 3FFU. Желтым цветом показаны α-спирали, красным — β-тяжи, зеленым — петли. В структуре примерно поровну представлены спирали и тяжи.
3. Отдельные цепи
- UniProt ID: Q6MPX4
- Название: BdRppH
- Функция: РНК-пирофосфогидролаза
- Мутации: Нет
- Модифицированные остатки: Нет
- UniProt ID: Q6MPX4
- Название: BdRppH
- Функция: РНК-пирофосфогидролаза
- Мутации: Нет
- Модифицированные остатки: Нет
5. Малые молекулы (лиганды)
| Краткое название | Полное название | Количество |
|---|---|---|
| GTP | GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE | 2 молекулы (по одной в цепях A и B) |
| MG | MAGNESIUM ION | 6 ионов (3 в цепи A, 3 в цепи B) |
Рисунок 3а. Молекула GTP в структуре 3FFU.
Рисунок 3б. Ионы магния в структуре 3FFU.
Файл со строками HETATM для молекул GTP и MG: