2024
2023
2022
2021
2020
2019
2018
2017
Обязательная контрольная по JalView
=====
Проверяется умение
- По заданному AC получить выравнивание из Pfam
- Определить сколько последовательностей в выравнивании
- Из выделенных последовательностей удалить совпадающие на 95%
- Добавить последовательность из банка, перевыровнять
- Связать последовательность с PDB-кодом, показать 3D структуру
- Покрасить выравнивание с учетом консервативности
Отключать-включать показ особенностей
- Отредактировать выравнивание:
- Удалить пустые колонки
- Удалить последовательности (например, те, у которых нет N- или С-концевых участков)
- Переместить буквы вправо-влево в выделенном блоке
- Удалить колонки (на N-конце, на C-конце выравнивания)
- Переместить последовательность или несколько последовательностей вверх или вниз
- Отсортировать последовательности одним из способов
- Выделить блок и зафиксировать его как группу
- Покрасить группу по консервативности
- Найти информацию в документации
- Добавить свою разметку выравнивания, скрыть одну из стандартных разметок
- Найти последовательность
- Найти паттерн в выравнивании
- Сохранить результат как проект (формат .jar)