Учебная страница курса биоинформатики,
год поступления 2011

Семестры Студенты Преподаватели

• 2024
• 2023
• 2022
• 2021
• 2020
• 2019
• 2018
• 2017

• ...

Зачёт по контрольной обязателен для зачёта за семестр

Проверяется умение

• По заданному AC получить выравнивание из Pfam
• Определить сколько последовательностей в выравнивании
• Из выделенных последовательностей удалить сходные по заданному проценту совпадений (например, 95%)
• Добавить последовательность из банка, перевыровнять
• Связать последовательность с PDB-кодом, показать 3D структуру
• Покрасить выравнивание с учетом консервативности

• Отключать-включать показ особенностей

• Отредактировать выравнивание:
  • Удалить пустые колонки
  • Удалить последовательности (например, те, у которых нет N- или С-концевых участков)
  • Переместить буквы вправо-влево в выделенном блоке
  • Удалить колонки (на N-конце, на C-конце выравнивания)
• Переместить последовательность или несколько последовательностей вверх или вниз
• Отсортировать последовательности одним из способов
• Выделить блок и зафиксировать его как группу
• Покрасить группу по консервативности
• Найти информацию в документации
• Добавить свою разметку выравнивания, скрыть одну из стандартных разметок
• Найти последовательность
• Найти паттерн в выравнивании
• Сохранить результат как проект (формат .jar)