Kodomo

Пользователь

Учебная страница курса биоинформатики,
год поступления 2011

Семестр IV. Эволюция последовательностей

Расписание занятий

Результаты (Только для студентов и преподавателей!)

Блок 1: филогенетические деревья

1. Что такое филогенетическое дерево (лекция)

12 февраля 2013, С.А.Спирин.

[презентация] [задания]

2. Реконструкция филогенетических деревьев

19 февраля 2013, С.А.Спирин.

[презентация] [задания]

3. Алгоритмы реконструкции деревьев

26 февраля 2013, С.А.Спирин.

[презентация] [задания]

4. Реконструкция деревьев по нуклеотидным последовательностям. Анализ деревьев, содержащих паралоги.

5 марта 2013, С.А.Спирин.

[задания]

Блок 2: функции белков

5. Классификация ферментов EC

12 марта 2013, С.А.Спирин

[презентация] [задания]

6. Киотская энциклопедия генов и геномов (KEGG)

19 марта 2013, С.А.Спирин

[презентация] [задания]

7. Функциональная роль гена в подсистеме. GO, SEED [,String]

26 марта 2013, А.В. Алексеевский

[презентация] [задания]

8. Особенности мембранных белков

2 апреля 2013, Д.В. Диброва, А.В. Алексеевский

[презентация] [задания] [подсказки]

Блок 3: Домены и их эволюция

9. Эволюционные домены

9 апреля 2013, А.В. Алексеевский

[презентация] [цель проекта] [задания] [подсказки] [скпипты]

10. Эволюционные домены

16 апреля 2013, А.В. Алексеевский

[контрольная по JalView] [задания]

11. Профили

23 апреля 2013, А.Алексеевский

[задание]

12. Анализ результатов поиска по профилю

30 апреля 2013, А.Алексеевский

[презентация] [задание]

13. Контрольная по профилям

7 мая 2013, А.Алексеевский

[контрольная] [RdRP in sw-viruses] [sw-viruses taxonomy]

вариант 1] вариант 2] вариант 3] вариант 4]

Котрольную, не завершенную на занятиях, можно завершить дома. Поверю во вторник.Результат положить в дир. Credits

Тем, кто не писал контрольную, будет предложено выполнить ее во вторник. AAl

14. Зачёт

14 мая 2013