Учебная страница курса биоинформатики,
год поступления 2011
Что нужно сделать для зачёта умения
Умение можно продемонстрировать выполнив соответствующие задания практикумов или дополнительных заданий.
Также можно предъявить любые результаты на заданное умение в отчете по анализу своей структуры или придумав свое задание. При этом нужно сообщить (при записи в очередь) какое умение и где проверять.
Умение |
Задания |
Комментарий |
Построение ЭП вокруг остатков |
|
|
Восстановление соседних ячеек |
|
|
Анализ Фурье |
|
|
Интерпретация особенностей РСА структур (occupancy, altercode, B-фактор, пропущенные остатки и т.п.) |
|
|
Интерпретация ЯМР структур |
|
|
Биологическая единица |
|
|
Определение вторичной структуры: DSSP или Stride; SheeP |
|
|
Определение типичных укладок и мотивов в структуре белка |
Контрольная 3 декабря |
|
Пространственное совмещение |
|
|
Нахождение гидрофобных кластеров: CluD |
|
|
Построение поверхности: pymol |
|
|
Домены: SCOP |
|