2024
2023
2022
2021
2020
2019
2018
2017
Семестр VII. Биоинформатика структур
Результаты (прим. Результаты контрольной по укладкам - см. P:\y11\Term_7\cw3d_results.xlsx )
Доп. тексты для подготовки к экзамену см. на диске P ... y11/term7/...
Новости
В среду 24 дек в 10:00 состоится неофициальный зачет.
В зачёт входит:
- РСА (с оценкой)
- отчёт по качеству расшифровки структуры
- доклад на журнальном клубе + реферат (с оценкой)
- зачёт умений (см. ведомость)
Если тема не сдана, то она переходит на экзамен.
При соотв. результатах получение пятерки за экзамен автоматом не исключается!
25 нояб. Это не новость, а сообщение. В экзаменационных билетах будут вопросы по докладам на журнальном клубе.
Актуальные задания
26 нояб
Демонстрация умений
[ умения ] [ задания ] [ укладки и мотивы ]
Журнальный клуб
[ темы ] [ про реферат ]
Отчёт по расшифровке структуры
[ отчёт по своей структуре ] [ указания ]
Блок 1: Основы рентгеноструктурного анализа
Лекция 1. Кристаллография макромолекул, часть 1
1 окт 2014
В.Ю. Лунин
[ презентация, вариант этого года ] [ текст к прошлогодней презентации ]
Занятие 1. Электронная плотность. Рассеяние на электроне.
2 окт 2014
А.Алексеевский
[ задание ] [ инструкции по pymol ] [ разъяснение об ЭП ]
Замечания по результатам проверки: типичные недостатки
Лекция 2. Кристаллография макромолекул, часть 2
8 окт 2014
В.Ю.Лунин
[ презентация, вариант этого года ] [ текст к прошлогодней презентации ]
Занятие 2. Восстановление окружения молекулы белка в кристалле. Ряд Фурье функции электронной плотности (одномерная модель)
9 окт 2014
А.Алексеевский, С.Спирин
[ задания ] [ pymol: подсказки ] [ "официальный" help ]
Занятие 3. Ряд Фурье функции электронной плотности
15 окт 2014
А.Алексеевский, С.Спирин
[ задание по восстановлению функции из пр.2 ]
Лекция 3. Водородные связи и вторичная структура белков. Алгоритмы DSSP и Stride.
16 окт 2014
С.А. Спирин
[ презентация ]
Лекция 4. Кристаллография макромолекул, часть 3
22 окт 2014
В.Ю.Лунин
[ презентация, вариант этого года ] [ текст к прошлогодней презентации ]
Занятие 4. Разрешение структуры
23 окт 2014
А.Алексеевский, С.Спирин
[ задание, входящее в отчет по анализу структур ]
Лекция 5. Оценка качества 3D структуры
29 окт 2014
А.В.Алексеевский
[ презентация ]
Занятие 5.
30 окт 2014
А.Алексеевский, С.Спирин
[ задания ]
Лекция 6. ЯМР. Многомодельные PDB-файлы
5 ноября 2014
С.А.Спирин
[ презентация ]
Занятие 6.
6 ноября 2014
А.Алексеевский, С.Спирин
Лекция 6. Пространственное совмещение
13 ноября 2014
Е.А. Аксянов
[ презентация ]
Лекция 7. Гидрофобные кластеры. Структурные домены
19 ноября 2014
А. Алексеевский
[ 1-кластеры ] [ 2-домены ]
Лекция 8. Структурные домены (окончание). Поверхность молекулы
20 ноября 2014
С. Спирин
[ 2-домены ] [ 3-поверхность ]
Лекции 9-10. Архитектура и топология. Структурные классификации
26-27 ноября 2014
Е. Аксянов
[ презентация ]
[ Контрольная по укладкам и мотивам]
(прим. Результаты контрольной по укладкам - см. P:\y11\Term_7\cw3d_results.xlsx )
Задания на будущее
[ отчёт по своей структуре ] [ указания ]
Журнальный клуб
[ темы ]