Учебная страница курса биоинформатики,
год поступления 2012
Блок 1. Зачетное задание по html
Создайте Ваш персональный учебный сайт. Этот сайт Вы будете пополнять в процессе обучения результатами выполнения практикумов и прочей информацией.
Сайт должен быть доступным в интернете, информативным и легко читаемым. Он станет Вашей "визитной карточкой" и позволит другим студентам, преподавателям и остальным пользователям интернета получить представление о Вас как о будущем ученом.
Для этого необходимо:
Осознать, для чего Вы создаете данный учебный сайт.
Продумать структуру и дизайн сайта.
Создать поддиректорию (директорию, папку) public_html в Вашей корневой директории (рядом с Вашей директорией term1), в которой будут храниться все файлы Вашего сайта. Эта директория должна содержать:
Файл index.html - главную страницу Вашего сайта. Файл главной страницы сайта должен иметь именно такое имя!
- Файл template.html - шаблон для ваших html-страниц.
- Поддиректорию images для графических файлов.
- Файл со стилями mystyle.css (возможно другое название).
Проверить доступность Вашей страницы из сети интернет по адресу: http://kodomo.fbb.msu.ru/~ваш_логин/.
Добавить html-страницы с результатами выполнения предыдущих заданий:
- об изучаемом Вами белке Zzzz (Zzzz - короткое имя белка).
- об изучаемой Вами бактерии Y.yyyy (Y.yyyy - первая буква родового названия, точка, видовое название бактерии).
Добавить остальные html-страницы
Карта вашего сайта должна быть такой:
Название страницы |
Имя файла с поддиректорией в public_html |
Содержание страницы |
Ссылки на страницы |
Главная |
index.html |
Пара слов о сайте, о вас (имя, фамилия) |
Первый семестр [, Второй, ...] |
Первый семестр |
term1/index.html |
Заголовок, минимальный текст о темах занятий |
Белок, Бактерия |
Белок |
term1/Zzzz/index.html |
Информация о белке, аминокислотная последовательность в fasta формате |
Источники информации о белке |
Бактерия |
term1/Y.yyyy/index.html |
Информация о бактерии, ее микрофотография |
Источники информации о бактерии |
О себе |
myself.html |
Своя фотография; e-mail. Все, что хотите рассказать о себе. |
Любые |
Заметки |
notes.html |
Произвольно |
Любые |
Ссылки |
links.html |
Произвольно |
fbb, msu, ... |
Требования и пожелания к страницам
Главная страница должна содержать следующую информацию:
- Описание сайта
- Меню со ссылками на:
Главная
Страница (-ы) семестров
О себе
Заметки
Ссылки
На Главной странице или на странице Заметки можно привести список задач, которые, по Вашему мнению, выполняет или будет выполнять Ваш сайт.
Страница семестров или первого семестра:
- При использовании одной страницы для всех семестров она должна содержать:
- Перечень семестров (первого, второго и др.)
- Ссылки на выполненные задания в каждом семестре. То есть в первом семестре уже должны быть:
Ссылка на страницу Белок
Ссылка на страницу Бактерия
- Меню
- Если Вы будете использовать отдельные страницы для каждого семестра, то на главной странице уже должны быть ссылки на первый и второй семестры.
Также на Странице семестра можно разместить любые записи по поводу учебного процесса в первом семестре
Страница Белок должна содержать следующую информацию:
- Название белка:
- полное (русск.)
- полное (англ.)
- сокращенное (англ.)
- Идентификаторы белка в разных БД:
SwissProt ID
- Uniprot AC
- PDB ID (PDB code)
- Количество аминокислотных остатков
- Последовательность белка в fasta-формате
Информация о функции белка и/или его локализации в клетке со ссылками на источники (это задание не является обязательным)
- Меню
- Страница будет пополняться результатами выполнения заданий блока 2.
- Название белка:
Страница Бактерия должна содержать следующую информацию:
- Название бактерии
- Таксономию с названиями таксонов, приведенными на русском языке
- Описание среды обитания, свойств и особенностей бактерии (со ссылками на источники)
- Ответ на вопрос, почему секвенировали геном данной бактерии (со ссылками на источники)
Авторов, название и аннотацию одной из статей о бактерии, найденной в БД PubMed; идентификатор статьи в PubMed (PMID); ссылку на аннотацию этой статьи в PubMed; запрос в PubMed, которым найдена эта статья
- Микрофотографию бактерии (культуры) (со ссылкой на источник)
- Другие интересные данные о бактерии
- Меню
- Страница будет пополняться результатами выполнения заданий блока 3.
На странице О себе желательно привести:
- Краткие сведения о себе
- Контактные данные
- Свою фотографию
- Перечень Ваших умений и навыков (владение иностранными языками, языками программирования, экспериментальными методиками и т.п.).
- Меню
- Также можно разместить свою краткую характеристику.
Наполнение страницы Заметки - на Ваше усмотрение.
На странице Ссылки предполагается размещение ссылок на полезные ресурсы. Начните со ссылок на:
- Официальный сайт МГУ
- Официальный сайт ФББ
Сервер kodomo
Допускается создание дополнительных страниц, относящихся к изучаемым объектам.
Содержание, оформление и язык страниц
- Основной язык сайта - русский. Однако английские копии страниц сайта приветствуются.
ОБЯЗАТЕЛЬНЫМ условием является понимание Вами того, что написано на Вашем сайте !!! Автоматический перевод приведет к штрафу и/или незачёту.
- На всех страницах должно присутствовать меню, с помощью которого можно попасть на основные страницы сайта.
- На всех страницах должен стоять ваш копирайт.
- На всех страницах рядом с копирайтом желательно добавлять дату последнего изменения страницы.