Учебная страница курса биоинформатики,
год поступления 2012
Семестр I. Объекты и инструменты
Расписание (проект)
Результаты (Только для студентов этого года и преподавателей!)
Блок 1: Linux, FAR Manager, интернет, HTML
1. Что такое биоинформатика?
А. Алексеевский
[презентация] [задания] [подсказки] [CRISPR]
2. Среда для работы: FAR (под Windows) и Linux
А. Алексеевский
[задания] [подсказки] [белок для работы] [инструкция по FAR]
3. GNU/Linux
Ю. Коростелёв, А. Алексеевский
[задания] [подсказки] [шпаргалка]
4. Интернет
Ю. Коростелёв, А. Алексеевский
[задания, подсказки] [бактерия для работы]
5. Создание Web-страничек
Ю. Коростелёв, С. Митрофанов, А. Алексеевский
[презентация] [задания] [HTML справка] [CSS справка] [Ещё одна справка] [Страничка из лекции] [Стиль из лекции]
6. Создание Web-страничек
С. Митрофанов, А. Алексеевский
[зачетное задание] [правила зачета по блоку] [Пример использования css] [Пример верстки таблицей] [Пример расположения элементов на странице]
[Кто кого проверяет] [Форма для оценки персональных сайтов] [Список выставленных оценок]
Каждый студент оценивает персональные сайты пяти однокурсников (см. Кто кого проверяет). Ссылка на форму для внесения оценок приведена выше.
7. Зачёт по FAR, по Linux и по порядку в директориях
С. Митрофанов, А. Алексеевский
[Минимум по Linux (bash)] [Минимум по FAR Manager] [Требования к файлам и директориям]
Образцы бывших мини-контрольных
[миниКР 1] [миниКР 2] [данные для миниКР 2] [миниКР 3] [миниКР 4]
Блок 2: Jmol: Введение в молекулярную структурную биологию
[16.12.2012] Страница обновлена, ознакомьтесь, пожалуйста [Про баллы и получение зачета за блок] |
8. Трехмерная структура белка: визуализация с помощью программы Jmol
Д. Диброва, С. Митрофанов, А. Алексеевский
[презентация] [задания] [подсказки] [PDB-файл 4ASU]
[Общие требования к оформлению протоколов]
9. Химическая структура и свойства аминокислот. ChemSketch для рисования структур молекул
Д. Диброва, С. Митрофанов, А. Алексеевский
[презентация] [задания] [подсказки] [условия контрольной для занятия №10]
10. Белок «сам с собой»: гидрофобные взаимодействия, водородные связи, солевые мостики
Д. Диброва, С. Митрофанов, А. Алексеевский
[презентация] [задания] [подсказки]
11. Белок и «лиганд»: с чем, как и зачем может взаимодействовать белок
Д. Диброва, С. Митрофанов, А. Алексеевский
[презентация] [задания] [подсказки]
12. База данных трехмерных структур PDB (Protein Data Bank)
Д. Диброва, С. Митрофанов, А. Алексеевский
Блок 3: Электронные таблицы
13. Электронные таблицы (MS-Excel)
С.А. Спирин
14. MS-Excel (продолжение)
С.А. Спирин
15. MS-Excel (контрольная работа)
С.А. Спирин