Kodomo

Пользователь

Учебная страница курса биоинформатики,
год поступления 2012

Зачетное задание по первому блоку (версия SIM)

  1. Создайте поддиректорию public_html в Вашей корневой директори, в которой будут храниться все файлы Вашего сайта. Эта директория должна содержать:

    1. Файл index.html - главную страницу Вашего сайта.
    2. Файл template.html - шаблон для ваших html-страниц.
    3. Поддиректорию images для графических файлов.
    4. Файл со стилями mystyle.css (возможно другое название).

  2. Проверьте доступность Вашей страницы из сети интернет по адресу: http://kodomo.fbb.msu.ru/~ваш_логин/.

  3. Добавьте html-страницы с результатами вполнения предыдущих заданий.

    1. Про Ваш белок Zzzz (Zzzz - короткое имя Вашего белка).
    2. Про Вашу бактерию Y.yyyy (Y.yyyy - первая буква родового названия, точка, видовое название Вашей бактерии).

  4. Карта вашего сайта должена быть такой:

Название страницы

Имя файла с поддиректорией в public_html

Содержание

Ссылки на страницы или файлы

Главная

index.html

Имя, фамилия; свое фото; e-mail

Первый семестр [, Второй, ...], fbb, msu

Немного о себе

myself.html

Все, что хотите рассказать о себе.

Как хотите

Первый семестр

term1/index.html

Заголовок, минимальный текст о темах занятий

Белок, Бактерия

Для заметок

notes.html

Произвольно

Как хотите

Белок

term1/Zzzz/index.html

Информация о белке, аминокислотная последовательность в fasta формате

Источники информации о белке

Бактерия

term1/Y.yyyy/index.html

Информация о бактерии, ее микрофотография

Источники информации о бактерии

Пояснения

  1. Страница Zzzz должна содержать следующую информацию:

    1. Название белка:
      • полное английское
      • полное русское
      • сокращенное (агл.)
    2. Идентификаторы белка в разных БД:
      • Uniprot ID
      • Uniprot AC
      • PDB ID
    3. Число аминокислотных остатков
    4. Последовательность в fasta-формате
    5. Страница будет пополняться результатами блока 2.

  2. Страница Y.yyyyy должна содержать следующую информацию:

    1. Название бактерии
    2. Таксономию с названиями таксонов на русском языке
    3. Описание среды обитания и особенностей (со ссылками на источники)
    4. Ответ на вопрос почему секвенировали ее геном (со ссылками на источники)

    5. Авторов, название и аннотацию одной из статей о бактерии, найденной в БД PubMed; иденитификатор статьи в PubMed (pmid); ссылку на аннотацию этой статьи в PubMed; запрос в PubMed, которым найдена эта статья

    6. Микрофотографию бактерии (или культуры) со ссылкой на источник
    7. Любые другие интересные данные о бактерии
    8. Страница будет пополняться результатами из блока 3.

  3. По желанию, можно создать дополнительные страницы, относящиеся к изучаемым объектам.

  4. Про содержание и язык страниц. Основной язык сайта - русский. ОБЯЗАТЕЛЬНЫМ условием является понимание Вами того, что написано (включая, разумеется, собственные гипотезы)!!! Автоматический перевод приведет к штрафу и/или незачёту.

  5. Страницы на английском языке допускаются, приветствуются и оцениваются премиальными баллами. Однако страница на английском обязана сопровождаться такой же страницей на русском языке.