Учебная страница курса биоинформатики,
год поступления 2012
Практикум 1. Задания
Обязательные задания
Заведите учетную запись на сервере kodomo.
- Настройте свой почтовый ящик на kodomo.
- Пошлите преподавателям (ААл, САС, ЮК, ...) письмо, содержащее:
- Вашу фамилию латинскими буквами в поле "Subject";
- приветствие преподавателям;
- несколько фраз о том, как Вы оцениваете свою компьютерную грамотность: какими программами умеете пользоваться, есть ли у Вас навыки программирования, как относитесь к компьютеру;
- пару фраз о том, насколько Вы владеете английским языком;
- любую другую информацию, которой Вам захотелось поделиться с преподавателями;
- Ваш адрес в Google Mail, если он есть;
- подпись: Ваше имя (каким именем подписываетесь, так к Вам, обычно, и обращаются в ответном письме).
Зайдите в доменную систему под своим пользовательским именем. На диске H создайте директорию term1, в ней поддиректорию block1, в ней поддиректорию pr1.
Дополнительные (не обязательные) задания
Результаты сохраните в файле Protocol.doc (или docx) в директории term1/block1/pr1 диска H. В конце занятия отошлите второе письмо преподавателям, присоединив к нему файл протокола.
Задания можно доделывать в часы работы компьютерного класса или дома и прислать до четверга включительно.
- * Определите время создания, объем в битах, байтах и килобайтах одного из файлов с расширением fasta, лежащего на диске P в директории y12. Используйте поиск.
- * Опишите, что содержится в файле.
- * Найдите повторы в последовательности. Выровняйте повторы (см. образец в презентации – она доступна на сайте kodomo.fbb.msu.ru/wiki и далее по ссылкам). Файл отправьте преподавателям.
- * (Для тех, кто знает кое-что про РНК.) Один повтор из CRISPR изображен на слайде 20 в презентации как шпилька (см. Рис.1). Найдите и отметьте в файле участки повтора, образующие стебель, и объясните почему образуется стебель.
|
Рисунок 1. Элементы вторичной структуры РНК: петля и стебель. |
- Прочтите в подсказке, как надо выключать компьютер. Выключите компьютер.