2024
2023
2022
2021
2020
2019
2018
2017
Практикум 2. Задания
Обязательные задания
Проверяться будyт файлы XXXXXXX_pr2.txt и XXXXXXX_protein.fasta, где "XXXXXXX" - Ваша фамилия, записанная латинскими буквами.
В конце работы эти файлы должны быть скопированы в директорию term1/block1/credits.
- Зайдите в систему, используя свое пользовательское имя и пароль.
- Настройте FAR Manager для удобной работы (см. инструкции по FAR). Настройте и сохраните:
- размер окна FAR и шрифта;
начальные директории (одна – P:/y12/term1/block1/pr2; другая – H:/);
- вид панелей (имя файла, расширение, размер, дата и время создания);
- относительную ширину панелей.
- Вынесите на рабочий стол иконку FAR.
- Создайте дерево директорий для практикумов и зачетных заданий в своей домашней директории с помощью команд FAR (на компьютере класса домашняя директория H:/)
- Назначьте клавиши быстрого перехода в Вашу директорию pr2 и директорию block1 на диске P:. Сочетания клавиш, соответственно, "правый Ctrl+1" и "правый Ctrl+2".
В директории pr2 создайте файл с именем вида 'XXXXXXX_pr2.txt', где "XXXXXXX" - Ваша фамилия, записанная латинскими буквами. Файл предназначен для протокола Вашей работы.
- Запишите дату.
- Запишите идентификаторы данного Вам белка.
- Сохраните в протоколе описание Вашего белка, взятое из записи с полным геномом бактерии Bacillus subtilis (см. подсказки). Скопируйте описание на английском, и, если что-то поймете, переведите на русский язык.
Используйте команду grep (под Linux)! Порядок действий:
- соединитесь с kodomo с помощью putty;
- перейдите в свою директорию pr2 на диске H;
- выполните команду grep, указав параметры:
- идентификатор вашего белка как слово, которое ищется;
имя файла, в котором искать слово (/P/y12/term1/block1/pr2/Bacillus_subtilis_strain_168). В этом файле лежит полная последовательность ДНК и описания белков.
Создайте файл XXXXXXX_protein.fasta с последовательностью Вашего белка в формате fasta.
Раскодируйте содержимое файла, имя которого начинается с very_very.... Сохраните в протоколе:
- полное имя файла;
- весь текст из этого файла, написанный кириллицей;
- hex-коды следующих символов в 3-х разных кодировках:
- русская буква "с",
- английская буква "c",
- символ пробела,
- символ конца строки.