Kodomo

Пользователь

Учебная страница курса биоинформатики,
год поступления 2012

Подсказки к занятию 7

К упражнению 1

К упражнению 2

Проведите поиск гомологов заданного белка по Swiss-Prot, при этом введите название таксона в окошко "Organism".

Если начать набирать название таксона, то интерфейс тут же начнёт подсказывать варианты; чтобы согласиться с одним из них, просто щёлките по нужному названию.

Если гомолог не найден, то вернитесь на страницу запроса (гиперссылка "blastp suite" в левом верхнем углу), введите название следующего таксона и т.д.

К упражнению 3

Для выравнивания двух последовательностей при задании параметров поиска отметьте галочку "Align two or more sequences". Вместо меню выбора банка данных появится окошко для ввода второй последовательности. Карту локального сходства можно найти на странице результатов в разделе "Dot Matrix View".

К упражнению 4

Задать матрицу, которую будет использовать BLAST при поиске, можно в разделе "Scoring Parameters" стандартного интерфейса.