2024
2023
2022
2021
2020
2019
2018
2017
Семестр II. Последовательности белков
Расписание (проект)
Результаты (Только для студентов этого года и преподавателей!)
Описания команд Unix и bash, написанные студентами
Описания команд EMBOSS, написанные студентами
Блок 1: Банки данных
1. Опять linux!
Д.Алексеевский, А.Алексеевский
2. Uniprot
А.Алексеевский, О.Занегина
[презентация] [задания] [подсказки]
3. SRS
О.Занегина, А.Алексеевский
4. PubMed
Е.Аксянов, А.Алексеевский
Блок 2: Выравнивание белковых последовательностей
[13.05.2013] [UPDATE] [ДД] Вывешиваю вопросы к зачету по моим практикумам, там же примерный порядок проведения зачета. Проверила задания у тех, кто сообщил до воскресения. Несколько человек из приславших в воскресение, увы, не спела проверить, но сделаю это за понедельник. Автоматы по зачету по блоку указаны в таблице. Обратите внимание: прием всех остальных заданий происходит на зачете.
5. Парное выравнивание белков
Д.Диброва, А.Алексеевский
[презентация] [задания] [подсказки] [подсказки по JalView] [скрипт evolve_protein.pl]
6. Алгоритмы парного выравнивания
Д.Диброва, А.Алексеевский
[презентация] [задания] [подсказки]
7. Программа BLAST
Ю. Пеков, С. Спирин
[презентация] [задания] [подсказки]
8. Множественное выравнивание
Д.Диброва, А.Алексеевский
[презентация] [задания] [подсказки]
[01.05.2013] [ДД] С днем Труда, дорогие студенты. В рамках помощи уже потрудившимся и намеревающимся потрудиться на праздниках я собрала комментарии к нескольким частым ошибкам при выполнении практикума №8.
Блок 3: Семейства белков
9. Паттерны и банк PROSITE
А.Алексеевский
[задания] [подсказки] [презентация]
10. Банк семейств белковых доменов Pfam
О.Занегина, А.Алексеевский
11. Частичное множественное выравнивание: MEME и MAST
А.Алексеевский
12. PSI-BLAST
А.Алексеевский
Занятие в группе 101 (той, у которой биоинформатика в пятницу) состоялось в понедельник 29 апреля, в 17:20. |
[презентация] [задания] [подсказки]
13. Зачёт
15 мая и 17 мая 9:00-11:00