2024
2023
2022
2021
2020
2019
2018
2017На этой странице вы найдете задания первого блока.
Содержание
Задание 1 (обязательное)
Повторить или выучить
- названия азотистых оснований, нуклеозидов и нуклеотидов (a,t,g,c,u), включая принцип нумерации атомов.
- структуру фосфодиэфирной связи,
- структуру водородных связей в канонических парах,
- различия в химическом строении ДНК и РНК.
Форма контроля — тест №1 и итоговая контрольная.
Задание 2 (обязательное)
Научиться рисовать нуклеотиды и фрагменты нуклеиновых кислот с помощью программы ChemSketch. Для работы дома можно взять архив P:/SupplMaterials/ChemSketch/chemsk8_.exe. Результаты сохранить в файле H:/term3/block1/pr1/nucl.sk2. В работе используйте готовые заготовки (Template > Template Window > DNA/RNA Kit).
Возможно использование альтернативных программ: Marvin Sketch, OpenBabel
Упр.1. Нарисовать на одном листе
- 2'-дезоксигуанозиндифосфат, 2'-дезокситимидинмонофосфат
- уридин
- псевдоуридин
- Пронумеровать атомы остатков азотистых оснований и сахара. Выделить красным цветом атомы, связанные N-гликозидной связью.
Упр.2. На следующей странице воспроизвести изображение фрагмента двухцепочечной ДНК, приведенное в презентации к занятию 1. См. подсказки.
Форма контроля — html страница на вашем сайте.
Задание 3 (дополнительное и отчасти исследовательское)
Сопоставить структуру водородных связей в канонических и теоретически возможных неканонических парах. Для заданного азотистого основанияна новом листе нарисовать каноническую пару и все возможные на ваш взгляд неканонические пары. Водородные связи указать пунктирными линиями. Для упрощения задачи работаем именно с основаниями, и будем считать, что донорами водорода являются группы -NH2 и >NH, а акцепторами водорода атомы О и N, которые не связаны с водородом. При выполнении упражнения полезно помнить, что водородные связи имеют примерно одинаковую длину и геометрию . То же упр., но выполненное с нуклеотидами и/или с рассмотрением возможных таутомеров (Chemsketch может показать варианты), будет оценено на более высокий балл.
Форма контроля — отчет на html странице вашего сайта.
Отчет, кроме изображений канонической пары и всех придуманных вами возможных неканонических пар должен содержать текст (Chemsketch это позволяет) с пояснениями, какие пары и почему представляются вам наиболее предпочтительными. Страницу с отчетом нужно представить до 3его занятия.