Учебная страница курса биоинформатики,
год поступления 2012
Cеместр III. Работа с последовательностями и структурами нуклеиновых кислот.
Студенты учатся работать с банками нуклеотидных последовательностей, знакомятся с пространственными структурами нуклеиновых кислот, учатся сравнивать нуклеотидные последовательности, а также получают первое представление о методах поиска кодирующих участков и слабых сигналов в последовательностях НК.
Результаты (Только для студентов и преподавателей!)
Блок 1: Структуры нуклеиновых кислот
1. Нуклеиновые кислоты, строение и структура (лекция)
3 сентября 2013, А.В. Головин
2. Химическое строение нуклеиновых кислот
10 сентября 2013, А.В. Головин
3. A- и В- формы ДНК. Структура РНК
17 сентября 2013, А.В. Головин.
4. Комплексы ДНК-белок
23 сентября 2013, А.В. Головин.
5. Итоговая контрольная
30 сентября 2013, А.В.Головин
Блок 2: распознавание генов и сигналов
6. Вступительная лекция
8 октября 2013, Е.О. Ермакова
7. Распознавание регуляторных сигналов
15 октября 2013, Д.А. Равчеев
[лекция] [задания] [варианты] [данные]
8. Распознавание регуляторных сигналов (семинар)
22 октября 2013, Д.А. Равчеев
9. Предсказание генов
29 октября 2013, Е.О. Ермакова
10. Предсказание генов (семинар)
5 ноября 2013, Е.О. Ермакова
Блок 3: банки последовательностей нуклеиновых кислот
11. Нуклеотидные банки данных
12 ноября 2013, М.А. Баранова и Ю.А. Пеков
12. Онлайн BLAST
19 ноября 2013, М.А. Баранова и Ю.А. Пеков
13. Standalone BLAST
26 ноября 2013, М.А. Баранова и Ю.А. Пеков
14. EMBOSS
3 декабря 2013, М.А. Баранова и Ю.А. Пеков
15. Геномные браузеры
10 декабря 2013, М.А. Баранова и Ю.А. Пеков
ИНСТРУКЦИЯ ПО ПРЕДСКАЗАНИЮ ГЕНОВ, ДОПОЛНЕННАЯ ПО МОТИВАМ ТИПИЧНЫХ ОШИБОК, ЗДЕСЬ: [ДОПОЛНЕННАЯ ИНСТРУКЦИЯ]
27 декабря – последняя в этом году пересдача зачёта.
Возникла проблема в связи с тем что целых 10 человек не вняли предупреждению о том, что седьмой практикум (поиск сигналов: MEME и rVista) должен быть сделан до 31 октября. Сейчас проверять его некому.
Решили, что те, у кого остался только седьмой практикум, а всё остальное сдано, получают зачёт в этом семестре, но для получения зачёта за следующий семестр они обязаны будут выполнить этот практикум.
Для получения формального зачёта сейчас ВСЁ ОСТАЛЬНОЕ ДОЛЖНО БЫТЬ СДАНО, в том числе и предсказание генов.