Kodomo

Пользователь

Учебная страница курса биоинформатики,
год поступления 2012

Cеместр III. Работа с последовательностями и структурами нуклеиновых кислот.

Студенты учатся работать с банками нуклеотидных последовательностей, знакомятся с пространственными структурами нуклеиновых кислот, учатся сравнивать нуклеотидные последовательности, а также получают первое представление о методах поиска кодирующих участков и слабых сигналов в последовательностях НК.

Расписание

Результаты (Только для студентов и преподавателей!)

Блок 1: Структуры нуклеиновых кислот

1. Нуклеиновые кислоты, строение и структура (лекция)

3 сентября 2013, А.В. Головин

[презентация]

2. Химическое строение нуклеиновых кислот

10 сентября 2013, А.В. Головин

[задания] [подсказки]

3. A- и В- формы ДНК. Структура РНК

17 сентября 2013, А.В. Головин.

[задания] [подсказки]

4. Комплексы ДНК-белок

23 сентября 2013, А.В. Головин.

[задания] [подсказки]

5. Итоговая контрольная

30 сентября 2013, А.В.Головин

Блок 2: распознавание генов и сигналов

6. Вступительная лекция

8 октября 2013, Е.О. Ермакова

[слайды]

7. Распознавание регуляторных сигналов

15 октября 2013, Д.А. Равчеев

[лекция] [задания] [варианты] [данные]

8. Распознавание регуляторных сигналов (семинар)

22 октября 2013, Д.А. Равчеев

9. Предсказание генов

29 октября 2013, Е.О. Ермакова

[слайды]

10. Предсказание генов (семинар)

5 ноября 2013, Е.О. Ермакова

[задания]

Блок 3: банки последовательностей нуклеиновых кислот

11. Нуклеотидные банки данных

12 ноября 2013, М.А. Баранова и Ю.А. Пеков

[презентация] [задания]

12. Онлайн BLAST

19 ноября 2013, М.А. Баранова и Ю.А. Пеков

[презентация] [Задания]

13. Standalone BLAST

26 ноября 2013, М.А. Баранова и Ю.А. Пеков

[презентация] [задания]

14. EMBOSS

3 декабря 2013, М.А. Баранова и Ю.А. Пеков

[задания]

15. Геномные браузеры

10 декабря 2013, М.А. Баранова и Ю.А. Пеков

[презентация] [задания]

ИНСТРУКЦИЯ ПО ПРЕДСКАЗАНИЮ ГЕНОВ, ДОПОЛНЕННАЯ ПО МОТИВАМ ТИПИЧНЫХ ОШИБОК, ЗДЕСЬ: [ДОПОЛНЕННАЯ ИНСТРУКЦИЯ]

27 декабря – последняя в этом году пересдача зачёта.

Возникла проблема в связи с тем что целых 10 человек не вняли предупреждению о том, что седьмой практикум (поиск сигналов: MEME и rVista) должен быть сделан до 31 октября. Сейчас проверять его некому.

Решили, что те, у кого остался только седьмой практикум, а всё остальное сдано, получают зачёт в этом семестре, но для получения зачёта за следующий семестр они обязаны будут выполнить этот практикум.

Для получения формального зачёта сейчас ВСЁ ОСТАЛЬНОЕ ДОЛЖНО БЫТЬ СДАНО, в том числе и предсказание генов.