2023
2022
2021
2020
2019
2018
2017
2016Коллеги!
Мы проверили все работы pr3, появившиеся в папке credis в срок (или на пару дней позже). Пишите, если вы выполнили работу позже или мы вашу работу забыли проверить.
Баллы "2" в клетке не есть оценка "двойка" 
Мы ставим 2 балла в том случае, когда ОБЯЗАТЕЛЬНЫ исправления, пусть даже мелкие. ЗАЧЁТ практикума проставляется в том случае, когда за каждое обязательное задание проставлено более половины max балла, в этом практикуме - >2.5 по заданиям 1, 2, 3 и за файл с последовательностью белка в формате fasta.
Балл "2" будет исправлен на больший, вплоть до 5, на усмотрение проверяющего, после исправления и сообщения с просьбой о перепроверке.
При проверке возможны расхождения в оценках. Так бывает и всегда (увы! бывают строгие и не очень строгие проверяющие), но в данном практикуме мы еще меняли подходы к оценкам в результате обсуждений.
Более того, комментарии к ячейке в ведомости за пр.3 не всегда отражены в баллах. Прочитать комментарии и исправить ошибки нужно даже при балле "5"! См. ниже почему надо исправлять.
Дорогие студенты, обратите внимание, что если Вы исправили свой протокол (и любые дополнительные файлы) ПОСЛЕ официального срока сдачи, то обязательно пошлите письмо всем преподавателям с сообщением об этом; скорее всего, Ваш файл уже был скачан для поверки автоматически в предыдущей версии, поэтому ее и будут проверять.
То же самое - послать письмо всем преподавателям с просьбой проверить, - следует сделать если Вы сдаете работу не в срок.
Если Вы исправили работу, присылайте письмо тому преподавателю, который у Вас ее проверял, с просьбой о перепроверке. ДД.
Как будут использоваться результаты практикума 3
- Кажется, мы - преподаватели - договорились, что по результатам блоков 1 и 2 студентам будет предложено написать краткий связный ОТЧЁТ о (i) геноме вируса; (2) геноме бактерии (частично, результаты будут получены с помощью написанного студентом скрипта на python); (3) гене и его продукте - белке.
- Отчёт будет перенесен вами на ваш сайт. Это задание входит в блок 3.
Мы (преподаватели) договорились, что к оформлению ПРОТОКОЛА главное требование - понятность. Конечно, оформление оценивается, но в отдельной колонке и на усмотрение проверяющего. Требование к оформлению ОТЧЁТА строже: нужен связный текст, даже если отчет занимает 1 страницу; есть правила оформления таблиц, рисунков; необходимы ссылки на источники информации. При этом отчет может быть один или два за семестр, а протоколов - много.
ААл
Типичные ошибки по существу
В таблице 2 перечислены все файлы из соответствующей папки в NCBI. Требовалось не это! Нужно было перечислить все ДНК, составляющие геном бактерии. Для этого нужно было отобрать все файлы с расширением .gbk. Каждый такой файл в папке с полным геномом содержит полную последовательность одной молекулы ДНК - хромосомы или плазмиды, - в формате GenBank. Другие файлы либо содержать те же данные, но в другом формате, либо содержат иную информацию.
- Длина белка - продукта гена - указана с ошибкой. Ошибка связана с тем, что в ген люди включают стоп-кодон (по понятной причине; рибосоме тоже нужен стоп-кодон, чтобы знать где остановить трансляцию).
Написано " Таблица 3. Информация о гене 3567566". Так писать нельзя! У гена есть название. Краткое название содержится в поле "/gene". Если его нет, а есть название белка, то можно написать "ген белка такого-то..." Если и название продукта нет или оно ничего не говорящее ("гипотетический белок"), то следует написать "ген с идентификатором geneID=3567566 в БД Gene, название гена не приведено". Вместо geneID можно указать локус: "ген, расположенный в локусе GSU1437". И ОБЯЗАТЕЛЬНО во всех случаях добавить "генома такого-то (идентификатор RefSeq NC_00....)".
Последняя ошибка спровоцирована тем, как мы сформулировали задания Приношу извинения за нее. Тем не менее, ошибка должна быть исправлена. Иначе рискуете ее повторить в отчете и на сайте.
Типичные ошибки по оформлению
- coming soon