2024
2023
2022
2021
2020
2019
2018
2017
Отчетность по блоку 2 (Трехмерная структуря белка. Визуализация с помощью Jmol)
1. Результаты практикумов
Выполнение практикумов: по окончании блока у на Вашем сайте должен появится раздел (web-страничка) "Описание трехмерной структуры белка X (идентификатор в базе данных PDB ZZZZ)" (где X - название Вашего белка, а ZZZZ - четырехбуквенный идентификатор белка в базе данных PDB). На этот раздел должна быть ссылка со страницы второго семестра. В этом разделе должны быть ссылки на отдельные странички, соответствующие практикумам:
Страничку "Общий вид структуры белка X (идентификатор PDB ZZZZ)" (результат выполнения pr2)
Страничку "Внутримолекулярные взаимодействия в белке X" (результат выполнения pr3)
Страничку "Взаимодействие белка X с лигандом Y" (результат выполнения pr4)
Страничку "Поиск структурных гомологов белка X с помощью PDBeFold" (результат выполнения pr5)
Выводы: после выполнения всех практикумов Вам надо будет на основной страничке раздела описать своими словами ту новую информацию, которую Вы узнали о своем белке, ссылаясь на полученные Вами рисунки.
2. Зачет по аминокислотам
Для получения зачета за блок помимо выполнения практикумов потребуется: продемонстрировать знание соответствия между однобуквенным, трехбуквенным кодом всех канонических двадцати аминокислот, их русскими названиями, структурными формулами и функциональными группами, к которым они принадлежат. Фактически, Вы должны понимать и помнить схему, приведенную на английской странице Википедии по аминокислотам.
Также потребуется уметь объяснить, что представляют собой стереоизомеры природных протеиногенных аминокислот, знать, какой из стереоизомеров встречается в белках.
3. За что можно получить дополнительные баллы
- за вдумчивое выполнение всех заданий практикумов и фиксирование своих наблюдений
- за аккуратное оформление работы
- за разработку полезных скриптов =)