2024
2023
2022
2021
2020
2019
2018
2017
Вопросы
РСА - рентгеноструктурный анализ
- Физическая основа: рассеяние рентгеновского излучения электронами
- электрическая составляющая эл-маг волны - колебание электрона - излуяение колеблющегося заряда
- РСА эксперимент
- схема-рисунок
- размер образца - кристалла белка
- расстояние до детектора
- что детектируется: интенсивность волны, рассеиваемой ВСЕМ образцом, в КАЖДОЙ точке детектора
- сигнал обнаруживается в отдельных точках детектора
- кристалл вращается, компьютер при детекторе учитывает это вращение для отслеживания "того же" сигнала
- От РСА к PDB-файлу с координатами атомов:
результат РСА - интенсивности отдельных сигналов - файл структурных факторов =>
=> решение "фазовой проблемы" с помощью дополнительного РСА эксперимента или 3D структуры гомолога - фазы структурных факторов =>
=> по файлу струкуутрных факторов с фазами - функциz электронной плотности (ЭП) в кристалле белка
=> по ЭП - координаты всех атомов
=> проверка соответствия координат экспериментальным данным и оптимизация координат
- Электронная плотность:
- определение функции ЭП, аргументы и значение
- физические единицы измерения ЭП
- графика зависимости электронной плотности от радиуса для одного атома
- почему максимум в центре ядра?
- восстановление координат атомов по функции электронной плотности для молекулы белка
- единицы измерения ЭП для PDB-файла
- способы изображения ЭП в компьютере
- Размеры:
- ядра атома
- радиус орбиты электрона у атома водорода
- длина волны рентгеновского излучения
- Теория рассеяния:
- одномерная электромагнитная волна
- длина,частота,амплитуда
- связь длины волны и частоты
- изменение во времени в данной точке
- изменение в пространстве в данный момент времени
- сложение двух волн с одинаковой длиной волны; фазы
- рассеяние волны электроном
- рассеяние двумя электронами:
- зависимость амплитуды от взаимного расположения электронов и направления рассеяния
- вектор рассеяния, каким он может быть (Г.М.Т. концов вектора рассеяния)
- одномерная электромагнитная волна
- Прямая и обратная задача теории рассеяния