2023
2022
2021
2020
2019
2018
2017
2016
Построение поверхности
1. Раскраска участка поверхности: pymol
Для комплекса димера пуринового репрессора с ДНК ( тут список ) создайте изображения: а) поверхности контакта мономера белка с симметричным мономером на фоне остовной (ribbon) модели мономера; б) поверхности контакта димера белков с двойной спиралью ДНК на фоне остовной модели части белка, вовлечённой в контакт; в) поверхности контакта ДНК с димером белков на фоне проволочной (sticks) модели двойной спирали.
2. Определите гидрофобные кластеры объёмом не менее 10 атомов на интерфейсе мономеров белка в том же комплексе.
Пользуйтесь сервисом CluD, Создайте то же изображение, что в задании 1, на котором поверхность, относящаяся к атомам, входящим в найденные гидрофобные кластеры, выделена цветом.